Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp2d40Q6P8N9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp2d40Q6P8N9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp2d40Q6P8N9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp2d40Q6P8N9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp2d40Q6P8N9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp2d40Q6P8N9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp2d40Q6P8N9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp2d40Q6P8N9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp2d40Q6P8N9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp2d40Q6P8N9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp2d40Q6P8N9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp2d40Q6P8N9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp2d40Q6P8N9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp2d40Q6P8N9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp2d40Q6P8N9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp2d40Q6P8N9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp2d40Q6P8N9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp2d40Q6P8N9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp2d40Q6P8N9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp2d40Q6P8N9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp2d40Q6P8N9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp2d40Q6P8N9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp2d40Q6P8N9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp2d40Q6P8N9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp2d40Q6P8N9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp2d40Q6P8N9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp2d40Q6P8N9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp2d40Q6P8N9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp2d40Q6P8N9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp2d40Q6P8N9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp2d40Q6P8N9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp2d40Q6P8N9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp2d40Q6P8N9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp2d40Q6P8N9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp2d40Q6P8N9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp2d40Q6P8N9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp2d40Q6P8N9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp2d40Q6P8N9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp2d40Q6P8N9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp2d40Q6P8N9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp2d40Q6P8N9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp2d40Q6P8N9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp2d40Q6P8N9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp2d40Q6P8N9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp2d40Q6P8N9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp2d40Q6P8N9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp2d40Q6P8N9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp2d40Q6P8N9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp2d40Q6P8N9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp2d40Q6P8N9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp2d40Q6P8N9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp2d40Q6P8N9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp2d40Q6P8N9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp2d40Q6P8N9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp2d40Q6P8N9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp2d40Q6P8N9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp2d40Q6P8N9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp2d40Q6P8N9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp2d40Q6P8N9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp2d40Q6P8N9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cyp2d40Q6P8N9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cyp2d40Q6P8N9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cyp2d40Q6P8N9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp2d40Q6P8N9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp2d40Q6P8N9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp2d40Q6P8N9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp2d40Q6P8N9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp2d40Q6P8N9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp2d40Q6P8N9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp2d40Q6P8N9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp2d40Q6P8N9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp2d40Q6P8N9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp2d40Q6P8N9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp2d40Q6P8N9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp2d40Q6P8N9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp2d40Q6P8N9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp2d40Q6P8N9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyp2d40Q6P8N9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyp2d40Q6P8N9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyp2d40Q6P8N9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyp2d40Q6P8N9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cyp2d40Q6P8N9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyp2d40Q6P8N9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyp2d40Q6P8N9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyp2d40Q6P8N9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyp2d40Q6P8N9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyp2d40Q6P8N9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyp2d40Q6P8N9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyp2d40Q6P8N9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyp2d40Q6P8N9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyp2d40Q6P8N9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp2d40Q6P8N9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp2d40Q6P8N9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp2d40Q6P8N9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp2d40Q6P8N9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp2d40Q6P8N9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp2d40Q6P8N9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms