Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Smchd1Q6P5D8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smchd1Q6P5D8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smchd1Q6P5D8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smchd1Q6P5D8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smchd1Q6P5D8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smchd1Q6P5D8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smchd1Q6P5D8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smchd1Q6P5D8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Smchd1Q6P5D8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Smchd1Q6P5D8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smchd1Q6P5D8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smchd1Q6P5D8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smchd1Q6P5D8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smchd1Q6P5D8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smchd1Q6P5D8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smchd1Q6P5D8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smchd1Q6P5D8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Smchd1Q6P5D8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smchd1Q6P5D8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smchd1Q6P5D8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smchd1Q6P5D8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smchd1Q6P5D8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Smchd1Q6P5D8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smchd1Q6P5D8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Smchd1Q6P5D8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Smchd1Q6P5D8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smchd1Q6P5D8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smchd1Q6P5D8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smchd1Q6P5D8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smchd1Q6P5D8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smchd1Q6P5D8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Smchd1Q6P5D8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smchd1Q6P5D8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smchd1Q6P5D8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smchd1Q6P5D8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smchd1Q6P5D8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smchd1Q6P5D8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smchd1Q6P5D8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smchd1Q6P5D8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smchd1Q6P5D8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smchd1Q6P5D8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smchd1Q6P5D8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smchd1Q6P5D8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smchd1Q6P5D8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smchd1Q6P5D8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smchd1Q6P5D8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smchd1Q6P5D8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Smchd1Q6P5D8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smchd1Q6P5D8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Smchd1Q6P5D8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smchd1Q6P5D8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smchd1Q6P5D8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smchd1Q6P5D8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smchd1Q6P5D8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smchd1Q6P5D8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smchd1Q6P5D8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smchd1Q6P5D8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smchd1Q6P5D8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smchd1Q6P5D8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smchd1Q6P5D8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smchd1Q6P5D8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smchd1Q6P5D8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Smchd1Q6P5D8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smchd1Q6P5D8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smchd1Q6P5D8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smchd1Q6P5D8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Smchd1Q6P5D8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smchd1Q6P5D8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smchd1Q6P5D8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smchd1Q6P5D8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smchd1Q6P5D8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smchd1Q6P5D8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smchd1Q6P5D8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smchd1Q6P5D8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smchd1Q6P5D8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smchd1Q6P5D8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smchd1Q6P5D8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smchd1Q6P5D8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smchd1Q6P5D8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smchd1Q6P5D8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smchd1Q6P5D8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smchd1Q6P5D8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smchd1Q6P5D8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smchd1Q6P5D8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smchd1Q6P5D8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smchd1Q6P5D8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smchd1Q6P5D8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smchd1Q6P5D8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smchd1Q6P5D8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smchd1Q6P5D8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smchd1Q6P5D8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smchd1Q6P5D8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smchd1Q6P5D8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smchd1Q6P5D8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smchd1Q6P5D8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smchd1Q6P5D8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smchd1Q6P5D8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smchd1Q6P5D8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smchd1Q6P5D8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
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