Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZN1

Pprc1, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pprc1Q6NZN1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
Pprc1Q6NZN1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Pprc1Q6NZN1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Pprc1Q6NZN1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Pprc1Q6NZN1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Pprc1Q6NZN1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Pprc1Q6NZN1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Pprc1Q6NZN1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
Pprc1Q6NZN1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
Pprc1Q6NZN1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Pprc1Q6NZN1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Pprc1Q6NZN1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Pprc1Q6NZN1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Pprc1Q6NZN1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Pprc1Q6NZN1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Pprc1Q6NZN1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Pprc1Q6NZN1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Pprc1Q6NZN1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Pprc1Q6NZN1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
Pprc1Q6NZN1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Pprc1Q6NZN1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Pprc1Q6NZN1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Pprc1Q6NZN1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Pprc1Q6NZN1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Pprc1Q6NZN1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Pprc1Q6NZN1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Pprc1Q6NZN1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Pprc1Q6NZN1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Pprc1Q6NZN1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Pprc1Q6NZN1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Pprc1Q6NZN1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Pprc1Q6NZN1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Pprc1Q6NZN1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
Pprc1Q6NZN1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Pprc1Q6NZN1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Pprc1Q6NZN1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Pprc1Q6NZN1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Pprc1Q6NZN1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Pprc1Q6NZN1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Pprc1Q6NZN1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Pprc1Q6NZN1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Pprc1Q6NZN1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Pprc1Q6NZN1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Pprc1Q6NZN1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Pprc1Q6NZN1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Pprc1Q6NZN1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Pprc1Q6NZN1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Pprc1Q6NZN1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Pprc1Q6NZN1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Pprc1Q6NZN1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Pprc1Q6NZN1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Pprc1Q6NZN1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Pprc1Q6NZN1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Pprc1Q6NZN1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
Pprc1Q6NZN1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Pprc1Q6NZN1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
Pprc1Q6NZN1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Pprc1Q6NZN1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Pprc1Q6NZN1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Pprc1Q6NZN1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Pprc1Q6NZN1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Pprc1Q6NZN1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Pprc1Q6NZN1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Pprc1Q6NZN1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Pprc1Q6NZN1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
Pprc1Q6NZN1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Pprc1Q6NZN1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Pprc1Q6NZN1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Pprc1Q6NZN1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Pprc1Q6NZN1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Pprc1Q6NZN1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Pprc1Q6NZN1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Pprc1Q6NZN1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Pprc1Q6NZN1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Pprc1Q6NZN1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Pprc1Q6NZN1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Pprc1Q6NZN1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Pprc1Q6NZN1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Pprc1Q6NZN1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Pprc1Q6NZN1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Pprc1Q6NZN1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Pprc1Q6NZN1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Pprc1Q6NZN1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Pprc1Q6NZN1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
Pprc1Q6NZN1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Pprc1Q6NZN1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Pprc1Q6NZN1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
Pprc1Q6NZN1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Pprc1Q6NZN1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Pprc1Q6NZN1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Pprc1Q6NZN1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Pprc1Q6NZN1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Pprc1Q6NZN1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Pprc1Q6NZN1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Pprc1Q6NZN1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Pprc1Q6NZN1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Pprc1Q6NZN1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Pprc1Q6NZN1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Pprc1Q6NZN1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Pprc1Q6NZN1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms