Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVG7

Colgalt2, Procollagen galactosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt2Q6NVG7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Colgalt2Q6NVG7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Colgalt2Q6NVG7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Colgalt2Q6NVG7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Colgalt2Q6NVG7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Colgalt2Q6NVG7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Colgalt2Q6NVG7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Colgalt2Q6NVG7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Colgalt2Q6NVG7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Colgalt2Q6NVG7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Colgalt2Q6NVG7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Colgalt2Q6NVG7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Colgalt2Q6NVG7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Colgalt2Q6NVG7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Colgalt2Q6NVG7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Colgalt2Q6NVG7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Colgalt2Q6NVG7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Colgalt2Q6NVG7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Colgalt2Q6NVG7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Colgalt2Q6NVG7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Colgalt2Q6NVG7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Colgalt2Q6NVG7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Colgalt2Q6NVG7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Colgalt2Q6NVG7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Colgalt2Q6NVG7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Colgalt2Q6NVG7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Colgalt2Q6NVG7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Colgalt2Q6NVG7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Colgalt2Q6NVG7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Colgalt2Q6NVG7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Colgalt2Q6NVG7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Colgalt2Q6NVG7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Colgalt2Q6NVG7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Colgalt2Q6NVG7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Colgalt2Q6NVG7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Colgalt2Q6NVG7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Colgalt2Q6NVG7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Colgalt2Q6NVG7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Colgalt2Q6NVG7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Colgalt2Q6NVG7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Colgalt2Q6NVG7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Colgalt2Q6NVG7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Colgalt2Q6NVG7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Colgalt2Q6NVG7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Colgalt2Q6NVG7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Colgalt2Q6NVG7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Colgalt2Q6NVG7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Colgalt2Q6NVG7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Colgalt2Q6NVG7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Colgalt2Q6NVG7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Colgalt2Q6NVG7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Colgalt2Q6NVG7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Colgalt2Q6NVG7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Colgalt2Q6NVG7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Colgalt2Q6NVG7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Colgalt2Q6NVG7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Colgalt2Q6NVG7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Colgalt2Q6NVG7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Colgalt2Q6NVG7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Colgalt2Q6NVG7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Colgalt2Q6NVG7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Colgalt2Q6NVG7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Colgalt2Q6NVG7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Colgalt2Q6NVG7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Colgalt2Q6NVG7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Colgalt2Q6NVG7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Colgalt2Q6NVG7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Colgalt2Q6NVG7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Colgalt2Q6NVG7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Colgalt2Q6NVG7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Colgalt2Q6NVG7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Colgalt2Q6NVG7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Colgalt2Q6NVG7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Colgalt2Q6NVG7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Colgalt2Q6NVG7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Colgalt2Q6NVG7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Colgalt2Q6NVG7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Colgalt2Q6NVG7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Colgalt2Q6NVG7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Colgalt2Q6NVG7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Colgalt2Q6NVG7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Colgalt2Q6NVG7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Colgalt2Q6NVG7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Colgalt2Q6NVG7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Colgalt2Q6NVG7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Colgalt2Q6NVG7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Colgalt2Q6NVG7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Colgalt2Q6NVG7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Colgalt2Q6NVG7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Colgalt2Q6NVG7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Colgalt2Q6NVG7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Colgalt2Q6NVG7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Colgalt2Q6NVG7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Colgalt2Q6NVG7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Colgalt2Q6NVG7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Colgalt2Q6NVG7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Colgalt2Q6NVG7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Colgalt2Q6NVG7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Colgalt2Q6NVG7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Colgalt2Q6NVG7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms