Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpsf6Q6NVF9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpsf6Q6NVF9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpsf6Q6NVF9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpsf6Q6NVF9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpsf6Q6NVF9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpsf6Q6NVF9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpsf6Q6NVF9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpsf6Q6NVF9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpsf6Q6NVF9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpsf6Q6NVF9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpsf6Q6NVF9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpsf6Q6NVF9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpsf6Q6NVF9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpsf6Q6NVF9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpsf6Q6NVF9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpsf6Q6NVF9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpsf6Q6NVF9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpsf6Q6NVF9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpsf6Q6NVF9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpsf6Q6NVF9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpsf6Q6NVF9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cpsf6Q6NVF9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cpsf6Q6NVF9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cpsf6Q6NVF9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpsf6Q6NVF9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpsf6Q6NVF9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpsf6Q6NVF9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpsf6Q6NVF9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpsf6Q6NVF9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpsf6Q6NVF9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpsf6Q6NVF9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpsf6Q6NVF9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpsf6Q6NVF9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpsf6Q6NVF9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpsf6Q6NVF9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpsf6Q6NVF9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpsf6Q6NVF9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpsf6Q6NVF9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpsf6Q6NVF9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpsf6Q6NVF9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpsf6Q6NVF9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpsf6Q6NVF9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpsf6Q6NVF9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpsf6Q6NVF9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpsf6Q6NVF9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpsf6Q6NVF9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cpsf6Q6NVF9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cpsf6Q6NVF9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cpsf6Q6NVF9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cpsf6Q6NVF9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpsf6Q6NVF9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpsf6Q6NVF9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpsf6Q6NVF9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpsf6Q6NVF9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpsf6Q6NVF9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpsf6Q6NVF9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpsf6Q6NVF9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpsf6Q6NVF9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpsf6Q6NVF9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpsf6Q6NVF9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpsf6Q6NVF9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpsf6Q6NVF9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpsf6Q6NVF9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpsf6Q6NVF9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpsf6Q6NVF9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpsf6Q6NVF9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpsf6Q6NVF9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpsf6Q6NVF9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpsf6Q6NVF9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpsf6Q6NVF9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpsf6Q6NVF9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpsf6Q6NVF9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpsf6Q6NVF9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpsf6Q6NVF9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpsf6Q6NVF9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpsf6Q6NVF9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpsf6Q6NVF9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpsf6Q6NVF9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpsf6Q6NVF9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpsf6Q6NVF9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpsf6Q6NVF9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpsf6Q6NVF9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpsf6Q6NVF9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpsf6Q6NVF9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpsf6Q6NVF9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpsf6Q6NVF9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpsf6Q6NVF9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpsf6Q6NVF9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpsf6Q6NVF9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpsf6Q6NVF9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpsf6Q6NVF9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpsf6Q6NVF9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpsf6Q6NVF9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpsf6Q6NVF9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpsf6Q6NVF9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpsf6Q6NVF9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpsf6Q6NVF9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpsf6Q6NVF9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpsf6Q6NVF9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.8 ms