Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HelbQ6NVF4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HelbQ6NVF4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HelbQ6NVF4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HelbQ6NVF4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HelbQ6NVF4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
HelbQ6NVF4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
HelbQ6NVF4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HelbQ6NVF4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HelbQ6NVF4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HelbQ6NVF4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HelbQ6NVF4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HelbQ6NVF4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HelbQ6NVF4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HelbQ6NVF4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HelbQ6NVF4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HelbQ6NVF4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HelbQ6NVF4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HelbQ6NVF4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HelbQ6NVF4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HelbQ6NVF4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HelbQ6NVF4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HelbQ6NVF4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HelbQ6NVF4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HelbQ6NVF4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HelbQ6NVF4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HelbQ6NVF4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HelbQ6NVF4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
HelbQ6NVF4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HelbQ6NVF4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HelbQ6NVF4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
HelbQ6NVF4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HelbQ6NVF4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
HelbQ6NVF4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HelbQ6NVF4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HelbQ6NVF4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HelbQ6NVF4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HelbQ6NVF4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HelbQ6NVF4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HelbQ6NVF4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HelbQ6NVF4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HelbQ6NVF4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HelbQ6NVF4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HelbQ6NVF4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HelbQ6NVF4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HelbQ6NVF4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HelbQ6NVF4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HelbQ6NVF4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HelbQ6NVF4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HelbQ6NVF4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HelbQ6NVF4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HelbQ6NVF4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HelbQ6NVF4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HelbQ6NVF4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HelbQ6NVF4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HelbQ6NVF4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HelbQ6NVF4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
HelbQ6NVF4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HelbQ6NVF4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HelbQ6NVF4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HelbQ6NVF4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HelbQ6NVF4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HelbQ6NVF4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
HelbQ6NVF4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HelbQ6NVF4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HelbQ6NVF4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HelbQ6NVF4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HelbQ6NVF4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HelbQ6NVF4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HelbQ6NVF4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HelbQ6NVF4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HelbQ6NVF4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HelbQ6NVF4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HelbQ6NVF4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HelbQ6NVF4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HelbQ6NVF4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
HelbQ6NVF4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
HelbQ6NVF4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HelbQ6NVF4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HelbQ6NVF4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HelbQ6NVF4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HelbQ6NVF4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HelbQ6NVF4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HelbQ6NVF4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HelbQ6NVF4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HelbQ6NVF4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HelbQ6NVF4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HelbQ6NVF4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HelbQ6NVF4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HelbQ6NVF4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HelbQ6NVF4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HelbQ6NVF4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HelbQ6NVF4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HelbQ6NVF4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HelbQ6NVF4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HelbQ6NVF4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HelbQ6NVF4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HelbQ6NVF4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
HelbQ6NVF4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
HelbQ6NVF4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms