Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE3

Spin2c, Spindlin-2C, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spin2cQ6NVE3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Spin2cQ6NVE3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Spin2cQ6NVE3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Spin2cQ6NVE3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Spin2cQ6NVE3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Spin2cQ6NVE3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Spin2cQ6NVE3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Spin2cQ6NVE3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Spin2cQ6NVE3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Spin2cQ6NVE3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Spin2cQ6NVE3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Spin2cQ6NVE3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Spin2cQ6NVE3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Spin2cQ6NVE3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Spin2cQ6NVE3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Spin2cQ6NVE3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Spin2cQ6NVE3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Spin2cQ6NVE3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Spin2cQ6NVE3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Spin2cQ6NVE3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Spin2cQ6NVE3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Spin2cQ6NVE3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Spin2cQ6NVE3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Spin2cQ6NVE3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Spin2cQ6NVE3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Spin2cQ6NVE3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Spin2cQ6NVE3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Spin2cQ6NVE3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Spin2cQ6NVE3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Spin2cQ6NVE3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Spin2cQ6NVE3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Spin2cQ6NVE3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Spin2cQ6NVE3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Spin2cQ6NVE3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Spin2cQ6NVE3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Spin2cQ6NVE3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Spin2cQ6NVE3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Spin2cQ6NVE3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Spin2cQ6NVE3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Spin2cQ6NVE3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Spin2cQ6NVE3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Spin2cQ6NVE3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Spin2cQ6NVE3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Spin2cQ6NVE3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Spin2cQ6NVE3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Spin2cQ6NVE3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Spin2cQ6NVE3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Spin2cQ6NVE3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Spin2cQ6NVE3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Spin2cQ6NVE3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Spin2cQ6NVE3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Spin2cQ6NVE3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Spin2cQ6NVE3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Spin2cQ6NVE3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Spin2cQ6NVE3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Spin2cQ6NVE3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Spin2cQ6NVE3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Spin2cQ6NVE3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Spin2cQ6NVE3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Spin2cQ6NVE3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Spin2cQ6NVE3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Spin2cQ6NVE3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Spin2cQ6NVE3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Spin2cQ6NVE3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Spin2cQ6NVE3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Spin2cQ6NVE3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Spin2cQ6NVE3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Spin2cQ6NVE3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Spin2cQ6NVE3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Spin2cQ6NVE3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Spin2cQ6NVE3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Spin2cQ6NVE3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Spin2cQ6NVE3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Spin2cQ6NVE3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Spin2cQ6NVE3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Spin2cQ6NVE3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Spin2cQ6NVE3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Spin2cQ6NVE3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Spin2cQ6NVE3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Spin2cQ6NVE3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Spin2cQ6NVE3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Spin2cQ6NVE3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Spin2cQ6NVE3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Spin2cQ6NVE3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Spin2cQ6NVE3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Spin2cQ6NVE3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Spin2cQ6NVE3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Spin2cQ6NVE3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Spin2cQ6NVE3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Spin2cQ6NVE3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Spin2cQ6NVE3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spin2cQ6NVE3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spin2cQ6NVE3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spin2cQ6NVE3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spin2cQ6NVE3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spin2cQ6NVE3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spin2cQ6NVE3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spin2cQ6NVE3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spin2cQ6NVE3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spin2cQ6NVE3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms