Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS60

Fbxo41, F-box only protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo41Q6NS60 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Fbxo41Q6NS60 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Fbxo41Q6NS60 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Fbxo41Q6NS60 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Fbxo41Q6NS60 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Fbxo41Q6NS60 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Fbxo41Q6NS60 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Fbxo41Q6NS60 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Fbxo41Q6NS60 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Fbxo41Q6NS60 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Fbxo41Q6NS60 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Fbxo41Q6NS60 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Fbxo41Q6NS60 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Fbxo41Q6NS60 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Fbxo41Q6NS60 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Fbxo41Q6NS60 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Fbxo41Q6NS60 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Fbxo41Q6NS60 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Fbxo41Q6NS60 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Fbxo41Q6NS60 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Fbxo41Q6NS60 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Fbxo41Q6NS60 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Fbxo41Q6NS60 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Fbxo41Q6NS60 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Fbxo41Q6NS60 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Fbxo41Q6NS60 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Fbxo41Q6NS60 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Fbxo41Q6NS60 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Fbxo41Q6NS60 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Fbxo41Q6NS60 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Fbxo41Q6NS60 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Fbxo41Q6NS60 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Fbxo41Q6NS60 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Fbxo41Q6NS60 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Fbxo41Q6NS60 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Fbxo41Q6NS60 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Fbxo41Q6NS60 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Fbxo41Q6NS60 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Fbxo41Q6NS60 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Fbxo41Q6NS60 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Fbxo41Q6NS60 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Fbxo41Q6NS60 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Fbxo41Q6NS60 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Fbxo41Q6NS60 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Fbxo41Q6NS60 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Fbxo41Q6NS60 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Fbxo41Q6NS60 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Fbxo41Q6NS60 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Fbxo41Q6NS60 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Fbxo41Q6NS60 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Fbxo41Q6NS60 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Fbxo41Q6NS60 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Fbxo41Q6NS60 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Fbxo41Q6NS60 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Fbxo41Q6NS60 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Fbxo41Q6NS60 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Fbxo41Q6NS60 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Fbxo41Q6NS60 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Fbxo41Q6NS60 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Fbxo41Q6NS60 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Fbxo41Q6NS60 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Fbxo41Q6NS60 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Fbxo41Q6NS60 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Fbxo41Q6NS60 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Fbxo41Q6NS60 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Fbxo41Q6NS60 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Fbxo41Q6NS60 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Fbxo41Q6NS60 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Fbxo41Q6NS60 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Fbxo41Q6NS60 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Fbxo41Q6NS60 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Fbxo41Q6NS60 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Fbxo41Q6NS60 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Fbxo41Q6NS60 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Fbxo41Q6NS60 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Fbxo41Q6NS60 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Fbxo41Q6NS60 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Fbxo41Q6NS60 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Fbxo41Q6NS60 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Fbxo41Q6NS60 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Fbxo41Q6NS60 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Fbxo41Q6NS60 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Fbxo41Q6NS60 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Fbxo41Q6NS60 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Fbxo41Q6NS60 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Fbxo41Q6NS60 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Fbxo41Q6NS60 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Fbxo41Q6NS60 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Fbxo41Q6NS60 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Fbxo41Q6NS60 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Fbxo41Q6NS60 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Fbxo41Q6NS60 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Fbxo41Q6NS60 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Fbxo41Q6NS60 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Fbxo41Q6NS60 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Fbxo41Q6NS60 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Fbxo41Q6NS60 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Fbxo41Q6NS60 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Fbxo41Q6NS60 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Fbxo41Q6NS60 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms