Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVL5

Lcn12, Epididymal-specific lipocalin-12, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn12Q6JVL5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lcn12Q6JVL5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lcn12Q6JVL5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lcn12Q6JVL5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lcn12Q6JVL5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lcn12Q6JVL5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lcn12Q6JVL5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lcn12Q6JVL5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lcn12Q6JVL5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lcn12Q6JVL5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lcn12Q6JVL5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lcn12Q6JVL5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lcn12Q6JVL5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lcn12Q6JVL5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lcn12Q6JVL5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lcn12Q6JVL5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lcn12Q6JVL5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Lcn12Q6JVL5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lcn12Q6JVL5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lcn12Q6JVL5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
Lcn12Q6JVL5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lcn12Q6JVL5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lcn12Q6JVL5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lcn12Q6JVL5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lcn12Q6JVL5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lcn12Q6JVL5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lcn12Q6JVL5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lcn12Q6JVL5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lcn12Q6JVL5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lcn12Q6JVL5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lcn12Q6JVL5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lcn12Q6JVL5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Lcn12Q6JVL5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lcn12Q6JVL5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lcn12Q6JVL5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Lcn12Q6JVL5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lcn12Q6JVL5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lcn12Q6JVL5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lcn12Q6JVL5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lcn12Q6JVL5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lcn12Q6JVL5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lcn12Q6JVL5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lcn12Q6JVL5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lcn12Q6JVL5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lcn12Q6JVL5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lcn12Q6JVL5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lcn12Q6JVL5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lcn12Q6JVL5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lcn12Q6JVL5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lcn12Q6JVL5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lcn12Q6JVL5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lcn12Q6JVL5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lcn12Q6JVL5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lcn12Q6JVL5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lcn12Q6JVL5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lcn12Q6JVL5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lcn12Q6JVL5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lcn12Q6JVL5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lcn12Q6JVL5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lcn12Q6JVL5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lcn12Q6JVL5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lcn12Q6JVL5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lcn12Q6JVL5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lcn12Q6JVL5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lcn12Q6JVL5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lcn12Q6JVL5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lcn12Q6JVL5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lcn12Q6JVL5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Lcn12Q6JVL5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lcn12Q6JVL5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lcn12Q6JVL5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lcn12Q6JVL5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lcn12Q6JVL5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lcn12Q6JVL5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lcn12Q6JVL5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lcn12Q6JVL5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lcn12Q6JVL5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lcn12Q6JVL5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Lcn12Q6JVL5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lcn12Q6JVL5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lcn12Q6JVL5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lcn12Q6JVL5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lcn12Q6JVL5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lcn12Q6JVL5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lcn12Q6JVL5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Lcn12Q6JVL5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lcn12Q6JVL5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lcn12Q6JVL5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lcn12Q6JVL5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lcn12Q6JVL5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lcn12Q6JVL5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Lcn12Q6JVL5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lcn12Q6JVL5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lcn12Q6JVL5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lcn12Q6JVL5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lcn12Q6JVL5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lcn12Q6JVL5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lcn12Q6JVL5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Lcn12Q6JVL5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lcn12Q6JVL5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms