Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Q6DFW0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q6DFW0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Q6DFW0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Q6DFW0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q6DFW0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q6DFW0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q6DFW0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q6DFW0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q6DFW0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q6DFW0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q6DFW0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q6DFW0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q6DFW0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Q6DFW0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q6DFW0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q6DFW0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q6DFW0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q6DFW0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q6DFW0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q6DFW0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q6DFW0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q6DFW0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q6DFW0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q6DFW0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q6DFW0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q6DFW0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q6DFW0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q6DFW0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q6DFW0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q6DFW0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q6DFW0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q6DFW0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q6DFW0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q6DFW0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q6DFW0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q6DFW0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q6DFW0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q6DFW0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q6DFW0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q6DFW0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q6DFW0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Q6DFW0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q6DFW0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q6DFW0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q6DFW0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q6DFW0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q6DFW0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q6DFW0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q6DFW0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q6DFW0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q6DFW0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q6DFW0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Q6DFW0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q6DFW0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q6DFW0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q6DFW0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q6DFW0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q6DFW0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q6DFW0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q6DFW0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q6DFW0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q6DFW0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q6DFW0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q6DFW0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q6DFW0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q6DFW0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q6DFW0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q6DFW0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q6DFW0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q6DFW0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q6DFW0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q6DFW0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q6DFW0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q6DFW0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q6DFW0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Q6DFW0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Q6DFW0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Q6DFW0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q6DFW0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
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