Protein–RNA interactions for Protein: Q6AXC6

Ddx11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx11Q6AXC6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ddx11Q6AXC6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ddx11Q6AXC6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ddx11Q6AXC6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ddx11Q6AXC6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ddx11Q6AXC6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ddx11Q6AXC6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ddx11Q6AXC6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ddx11Q6AXC6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ddx11Q6AXC6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ddx11Q6AXC6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ddx11Q6AXC6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ddx11Q6AXC6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Ddx11Q6AXC6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ddx11Q6AXC6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ddx11Q6AXC6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ddx11Q6AXC6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ddx11Q6AXC6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Ddx11Q6AXC6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Ddx11Q6AXC6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ddx11Q6AXC6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Ddx11Q6AXC6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ddx11Q6AXC6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ddx11Q6AXC6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ddx11Q6AXC6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ddx11Q6AXC6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ddx11Q6AXC6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ddx11Q6AXC6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ddx11Q6AXC6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ddx11Q6AXC6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ddx11Q6AXC6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ddx11Q6AXC6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ddx11Q6AXC6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ddx11Q6AXC6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ddx11Q6AXC6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ddx11Q6AXC6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ddx11Q6AXC6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ddx11Q6AXC6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ddx11Q6AXC6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ddx11Q6AXC6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ddx11Q6AXC6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ddx11Q6AXC6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Ddx11Q6AXC6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ddx11Q6AXC6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ddx11Q6AXC6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ddx11Q6AXC6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ddx11Q6AXC6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ddx11Q6AXC6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ddx11Q6AXC6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ddx11Q6AXC6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ddx11Q6AXC6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ddx11Q6AXC6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ddx11Q6AXC6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ddx11Q6AXC6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ddx11Q6AXC6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ddx11Q6AXC6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ddx11Q6AXC6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ddx11Q6AXC6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ddx11Q6AXC6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ddx11Q6AXC6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ddx11Q6AXC6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ddx11Q6AXC6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ddx11Q6AXC6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ddx11Q6AXC6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ddx11Q6AXC6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ddx11Q6AXC6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ddx11Q6AXC6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ddx11Q6AXC6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ddx11Q6AXC6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ddx11Q6AXC6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Ddx11Q6AXC6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ddx11Q6AXC6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Ddx11Q6AXC6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ddx11Q6AXC6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ddx11Q6AXC6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ddx11Q6AXC6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ddx11Q6AXC6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Ddx11Q6AXC6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ddx11Q6AXC6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ddx11Q6AXC6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ddx11Q6AXC6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ddx11Q6AXC6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ddx11Q6AXC6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ddx11Q6AXC6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ddx11Q6AXC6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ddx11Q6AXC6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ddx11Q6AXC6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ddx11Q6AXC6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ddx11Q6AXC6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ddx11Q6AXC6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ddx11Q6AXC6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ddx11Q6AXC6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ddx11Q6AXC6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ddx11Q6AXC6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ddx11Q6AXC6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ddx11Q6AXC6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ddx11Q6AXC6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ddx11Q6AXC6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ddx11Q6AXC6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ddx11Q6AXC6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119 ms