Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rftn1Q6A0D4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rftn1Q6A0D4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rftn1Q6A0D4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rftn1Q6A0D4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rftn1Q6A0D4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rftn1Q6A0D4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rftn1Q6A0D4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rftn1Q6A0D4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rftn1Q6A0D4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rftn1Q6A0D4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rftn1Q6A0D4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rftn1Q6A0D4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rftn1Q6A0D4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rftn1Q6A0D4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Rftn1Q6A0D4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rftn1Q6A0D4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rftn1Q6A0D4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rftn1Q6A0D4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rftn1Q6A0D4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rftn1Q6A0D4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Rftn1Q6A0D4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Rftn1Q6A0D4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rftn1Q6A0D4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rftn1Q6A0D4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rftn1Q6A0D4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rftn1Q6A0D4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rftn1Q6A0D4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rftn1Q6A0D4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rftn1Q6A0D4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rftn1Q6A0D4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rftn1Q6A0D4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rftn1Q6A0D4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rftn1Q6A0D4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rftn1Q6A0D4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rftn1Q6A0D4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rftn1Q6A0D4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Rftn1Q6A0D4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rftn1Q6A0D4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rftn1Q6A0D4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rftn1Q6A0D4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rftn1Q6A0D4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rftn1Q6A0D4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rftn1Q6A0D4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rftn1Q6A0D4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rftn1Q6A0D4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rftn1Q6A0D4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rftn1Q6A0D4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rftn1Q6A0D4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rftn1Q6A0D4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rftn1Q6A0D4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rftn1Q6A0D4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rftn1Q6A0D4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rftn1Q6A0D4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rftn1Q6A0D4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Rftn1Q6A0D4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rftn1Q6A0D4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rftn1Q6A0D4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rftn1Q6A0D4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rftn1Q6A0D4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rftn1Q6A0D4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rftn1Q6A0D4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rftn1Q6A0D4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rftn1Q6A0D4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rftn1Q6A0D4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rftn1Q6A0D4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rftn1Q6A0D4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rftn1Q6A0D4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rftn1Q6A0D4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Rftn1Q6A0D4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rftn1Q6A0D4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rftn1Q6A0D4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rftn1Q6A0D4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rftn1Q6A0D4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rftn1Q6A0D4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rftn1Q6A0D4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rftn1Q6A0D4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rftn1Q6A0D4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rftn1Q6A0D4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rftn1Q6A0D4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rftn1Q6A0D4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rftn1Q6A0D4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rftn1Q6A0D4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rftn1Q6A0D4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rftn1Q6A0D4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rftn1Q6A0D4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rftn1Q6A0D4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rftn1Q6A0D4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rftn1Q6A0D4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rftn1Q6A0D4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rftn1Q6A0D4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rftn1Q6A0D4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rftn1Q6A0D4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rftn1Q6A0D4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rftn1Q6A0D4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rftn1Q6A0D4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rftn1Q6A0D4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rftn1Q6A0D4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rftn1Q6A0D4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rftn1Q6A0D4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms