Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.92
Top2bQ64511 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
Top2bQ64511 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.91
Top2bQ64511 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.91
Top2bQ64511 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Top2bQ64511 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Top2bQ64511 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
Top2bQ64511 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Top2bQ64511 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Top2bQ64511 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
Top2bQ64511 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Top2bQ64511 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Top2bQ64511 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Top2bQ64511 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
Top2bQ64511 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Top2bQ64511 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
Top2bQ64511 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Top2bQ64511 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Top2bQ64511 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Top2bQ64511 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Top2bQ64511 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Top2bQ64511 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Top2bQ64511 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Top2bQ64511 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC39.4■■■■□ 3.9
Top2bQ64511 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
Top2bQ64511 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
Top2bQ64511 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
Top2bQ64511 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Top2bQ64511 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
Top2bQ64511 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
Top2bQ64511 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Top2bQ64511 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Top2bQ64511 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC39.34■■■■□ 3.89
Top2bQ64511 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Top2bQ64511 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
Top2bQ64511 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Top2bQ64511 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Top2bQ64511 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
Top2bQ64511 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
Top2bQ64511 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Top2bQ64511 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
Top2bQ64511 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Top2bQ64511 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC39.3■■■■□ 3.88
Top2bQ64511 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
Top2bQ64511 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Top2bQ64511 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
Top2bQ64511 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Top2bQ64511 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
Top2bQ64511 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC39.27■■■■□ 3.88
Top2bQ64511 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Top2bQ64511 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC39.27■■■■□ 3.88
Top2bQ64511 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
Top2bQ64511 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Top2bQ64511 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Top2bQ64511 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
Top2bQ64511 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
Top2bQ64511 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
Top2bQ64511 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Top2bQ64511 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Top2bQ64511 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Top2bQ64511 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Top2bQ64511 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Top2bQ64511 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC39.23■■■■□ 3.87
Top2bQ64511 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Top2bQ64511 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
Top2bQ64511 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Top2bQ64511 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Top2bQ64511 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Top2bQ64511 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Top2bQ64511 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Top2bQ64511 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
Top2bQ64511 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
Top2bQ64511 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Top2bQ64511 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Top2bQ64511 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Top2bQ64511 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Top2bQ64511 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Top2bQ64511 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
Top2bQ64511 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
Top2bQ64511 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
Top2bQ64511 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
Top2bQ64511 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Top2bQ64511 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
Top2bQ64511 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Top2bQ64511 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Top2bQ64511 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC39.11■■■■□ 3.85
Top2bQ64511 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Top2bQ64511 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
Top2bQ64511 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Top2bQ64511 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Top2bQ64511 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Top2bQ64511 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Top2bQ64511 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
Top2bQ64511 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Top2bQ64511 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Top2bQ64511 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.85
Top2bQ64511 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.84
Top2bQ64511 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
Top2bQ64511 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
Top2bQ64511 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.1 ms