Protein–RNA interactions for Protein: Q64151

Sema4c, Semaphorin-4C, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4cQ64151 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema4cQ64151 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema4cQ64151 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema4cQ64151 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema4cQ64151 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema4cQ64151 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema4cQ64151 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema4cQ64151 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema4cQ64151 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema4cQ64151 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema4cQ64151 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema4cQ64151 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema4cQ64151 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema4cQ64151 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema4cQ64151 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema4cQ64151 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema4cQ64151 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema4cQ64151 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema4cQ64151 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema4cQ64151 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema4cQ64151 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema4cQ64151 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema4cQ64151 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema4cQ64151 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema4cQ64151 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema4cQ64151 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema4cQ64151 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema4cQ64151 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema4cQ64151 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema4cQ64151 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema4cQ64151 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema4cQ64151 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema4cQ64151 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema4cQ64151 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema4cQ64151 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema4cQ64151 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema4cQ64151 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema4cQ64151 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema4cQ64151 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema4cQ64151 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema4cQ64151 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema4cQ64151 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema4cQ64151 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema4cQ64151 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema4cQ64151 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema4cQ64151 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema4cQ64151 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema4cQ64151 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema4cQ64151 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema4cQ64151 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema4cQ64151 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema4cQ64151 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema4cQ64151 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema4cQ64151 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema4cQ64151 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema4cQ64151 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sema4cQ64151 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema4cQ64151 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema4cQ64151 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema4cQ64151 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema4cQ64151 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema4cQ64151 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema4cQ64151 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema4cQ64151 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema4cQ64151 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema4cQ64151 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema4cQ64151 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema4cQ64151 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema4cQ64151 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema4cQ64151 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema4cQ64151 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema4cQ64151 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema4cQ64151 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema4cQ64151 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema4cQ64151 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema4cQ64151 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema4cQ64151 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema4cQ64151 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema4cQ64151 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema4cQ64151 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema4cQ64151 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema4cQ64151 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema4cQ64151 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema4cQ64151 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sema4cQ64151 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sema4cQ64151 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sema4cQ64151 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema4cQ64151 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema4cQ64151 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema4cQ64151 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema4cQ64151 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema4cQ64151 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema4cQ64151 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema4cQ64151 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema4cQ64151 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema4cQ64151 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema4cQ64151 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema4cQ64151 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema4cQ64151 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema4cQ64151 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms