Protein–RNA interactions for Protein: Q64028

Phc1, Polyhomeotic-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc1Q64028 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Phc1Q64028 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Phc1Q64028 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Phc1Q64028 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Phc1Q64028 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Phc1Q64028 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Phc1Q64028 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Phc1Q64028 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Phc1Q64028 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Phc1Q64028 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Phc1Q64028 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Phc1Q64028 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Phc1Q64028 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Phc1Q64028 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Phc1Q64028 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Phc1Q64028 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Phc1Q64028 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Phc1Q64028 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Phc1Q64028 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phc1Q64028 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phc1Q64028 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Phc1Q64028 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phc1Q64028 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phc1Q64028 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phc1Q64028 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phc1Q64028 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phc1Q64028 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Phc1Q64028 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Phc1Q64028 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Phc1Q64028 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Phc1Q64028 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Phc1Q64028 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Phc1Q64028 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Phc1Q64028 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Phc1Q64028 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Phc1Q64028 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Phc1Q64028 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phc1Q64028 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phc1Q64028 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phc1Q64028 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phc1Q64028 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phc1Q64028 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phc1Q64028 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phc1Q64028 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phc1Q64028 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phc1Q64028 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phc1Q64028 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phc1Q64028 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Phc1Q64028 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Phc1Q64028 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Phc1Q64028 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Phc1Q64028 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Phc1Q64028 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Phc1Q64028 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Phc1Q64028 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Phc1Q64028 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Phc1Q64028 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Phc1Q64028 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Phc1Q64028 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Phc1Q64028 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Phc1Q64028 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Phc1Q64028 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Phc1Q64028 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Phc1Q64028 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Phc1Q64028 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Phc1Q64028 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Phc1Q64028 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Phc1Q64028 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Phc1Q64028 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phc1Q64028 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phc1Q64028 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Phc1Q64028 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Phc1Q64028 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Phc1Q64028 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Phc1Q64028 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Phc1Q64028 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Phc1Q64028 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Phc1Q64028 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Phc1Q64028 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phc1Q64028 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phc1Q64028 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phc1Q64028 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phc1Q64028 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phc1Q64028 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phc1Q64028 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phc1Q64028 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phc1Q64028 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phc1Q64028 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phc1Q64028 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phc1Q64028 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phc1Q64028 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phc1Q64028 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Phc1Q64028 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Phc1Q64028 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Phc1Q64028 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Phc1Q64028 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Phc1Q64028 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Phc1Q64028 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Phc1Q64028 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phc1Q64028 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.7 ms