Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CcncQ62447 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CcncQ62447 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CcncQ62447 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CcncQ62447 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CcncQ62447 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CcncQ62447 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CcncQ62447 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CcncQ62447 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CcncQ62447 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CcncQ62447 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CcncQ62447 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CcncQ62447 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CcncQ62447 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CcncQ62447 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CcncQ62447 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CcncQ62447 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CcncQ62447 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CcncQ62447 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CcncQ62447 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CcncQ62447 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CcncQ62447 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CcncQ62447 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CcncQ62447 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CcncQ62447 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CcncQ62447 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CcncQ62447 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CcncQ62447 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CcncQ62447 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CcncQ62447 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CcncQ62447 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CcncQ62447 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CcncQ62447 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CcncQ62447 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CcncQ62447 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CcncQ62447 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CcncQ62447 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CcncQ62447 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CcncQ62447 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CcncQ62447 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CcncQ62447 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CcncQ62447 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CcncQ62447 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CcncQ62447 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CcncQ62447 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CcncQ62447 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CcncQ62447 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CcncQ62447 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CcncQ62447 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CcncQ62447 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CcncQ62447 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CcncQ62447 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CcncQ62447 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CcncQ62447 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CcncQ62447 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CcncQ62447 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CcncQ62447 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CcncQ62447 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CcncQ62447 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CcncQ62447 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CcncQ62447 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CcncQ62447 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CcncQ62447 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CcncQ62447 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CcncQ62447 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CcncQ62447 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CcncQ62447 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CcncQ62447 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CcncQ62447 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CcncQ62447 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CcncQ62447 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CcncQ62447 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CcncQ62447 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CcncQ62447 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CcncQ62447 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CcncQ62447 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CcncQ62447 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CcncQ62447 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CcncQ62447 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CcncQ62447 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CcncQ62447 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CcncQ62447 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CcncQ62447 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CcncQ62447 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CcncQ62447 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CcncQ62447 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CcncQ62447 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CcncQ62447 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CcncQ62447 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CcncQ62447 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CcncQ62447 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CcncQ62447 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CcncQ62447 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CcncQ62447 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CcncQ62447 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CcncQ62447 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CcncQ62447 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CcncQ62447 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CcncQ62447 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CcncQ62447 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms