Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Taf6Q62311 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Taf6Q62311 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Taf6Q62311 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Taf6Q62311 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Taf6Q62311 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Taf6Q62311 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Taf6Q62311 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Taf6Q62311 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Taf6Q62311 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Taf6Q62311 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Taf6Q62311 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Taf6Q62311 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Taf6Q62311 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Taf6Q62311 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Taf6Q62311 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Taf6Q62311 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Taf6Q62311 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Taf6Q62311 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Taf6Q62311 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Taf6Q62311 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Taf6Q62311 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Taf6Q62311 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Taf6Q62311 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Taf6Q62311 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Taf6Q62311 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Taf6Q62311 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Taf6Q62311 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Taf6Q62311 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Taf6Q62311 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Taf6Q62311 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Taf6Q62311 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Taf6Q62311 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Taf6Q62311 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Taf6Q62311 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Taf6Q62311 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Taf6Q62311 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Taf6Q62311 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Taf6Q62311 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Taf6Q62311 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Taf6Q62311 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Taf6Q62311 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Taf6Q62311 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Taf6Q62311 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf6Q62311 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf6Q62311 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf6Q62311 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf6Q62311 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf6Q62311 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf6Q62311 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf6Q62311 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf6Q62311 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf6Q62311 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf6Q62311 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf6Q62311 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf6Q62311 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf6Q62311 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Taf6Q62311 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Taf6Q62311 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf6Q62311 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf6Q62311 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf6Q62311 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf6Q62311 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf6Q62311 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf6Q62311 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf6Q62311 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf6Q62311 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf6Q62311 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf6Q62311 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf6Q62311 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf6Q62311 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf6Q62311 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf6Q62311 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf6Q62311 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf6Q62311 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf6Q62311 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf6Q62311 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf6Q62311 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf6Q62311 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf6Q62311 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf6Q62311 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf6Q62311 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf6Q62311 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf6Q62311 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf6Q62311 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf6Q62311 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf6Q62311 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf6Q62311 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Taf6Q62311 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Taf6Q62311 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Taf6Q62311 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Taf6Q62311 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Taf6Q62311 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Taf6Q62311 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Taf6Q62311 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Taf6Q62311 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Taf6Q62311 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Taf6Q62311 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Taf6Q62311 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Taf6Q62311 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms