Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SnrpcQ62241 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SnrpcQ62241 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SnrpcQ62241 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SnrpcQ62241 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SnrpcQ62241 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SnrpcQ62241 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SnrpcQ62241 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SnrpcQ62241 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SnrpcQ62241 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SnrpcQ62241 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SnrpcQ62241 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SnrpcQ62241 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SnrpcQ62241 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SnrpcQ62241 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SnrpcQ62241 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SnrpcQ62241 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SnrpcQ62241 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SnrpcQ62241 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SnrpcQ62241 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SnrpcQ62241 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SnrpcQ62241 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SnrpcQ62241 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SnrpcQ62241 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SnrpcQ62241 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SnrpcQ62241 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SnrpcQ62241 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SnrpcQ62241 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SnrpcQ62241 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SnrpcQ62241 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SnrpcQ62241 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SnrpcQ62241 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SnrpcQ62241 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SnrpcQ62241 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SnrpcQ62241 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SnrpcQ62241 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SnrpcQ62241 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SnrpcQ62241 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SnrpcQ62241 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SnrpcQ62241 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SnrpcQ62241 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SnrpcQ62241 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SnrpcQ62241 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SnrpcQ62241 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SnrpcQ62241 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SnrpcQ62241 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SnrpcQ62241 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SnrpcQ62241 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SnrpcQ62241 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SnrpcQ62241 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SnrpcQ62241 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SnrpcQ62241 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SnrpcQ62241 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SnrpcQ62241 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SnrpcQ62241 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SnrpcQ62241 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SnrpcQ62241 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SnrpcQ62241 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SnrpcQ62241 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SnrpcQ62241 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SnrpcQ62241 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SnrpcQ62241 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SnrpcQ62241 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SnrpcQ62241 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SnrpcQ62241 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SnrpcQ62241 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SnrpcQ62241 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SnrpcQ62241 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SnrpcQ62241 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SnrpcQ62241 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SnrpcQ62241 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SnrpcQ62241 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SnrpcQ62241 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SnrpcQ62241 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SnrpcQ62241 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SnrpcQ62241 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SnrpcQ62241 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SnrpcQ62241 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SnrpcQ62241 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SnrpcQ62241 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SnrpcQ62241 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SnrpcQ62241 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SnrpcQ62241 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SnrpcQ62241 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SnrpcQ62241 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SnrpcQ62241 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SnrpcQ62241 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SnrpcQ62241 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SnrpcQ62241 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SnrpcQ62241 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SnrpcQ62241 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SnrpcQ62241 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SnrpcQ62241 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SnrpcQ62241 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SnrpcQ62241 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SnrpcQ62241 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SnrpcQ62241 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SnrpcQ62241 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SnrpcQ62241 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SnrpcQ62241 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms