Protein–RNA interactions for Protein: Q62192

Cd180, CD180 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd180Q62192 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cd180Q62192 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cd180Q62192 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cd180Q62192 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Cd180Q62192 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cd180Q62192 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cd180Q62192 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cd180Q62192 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cd180Q62192 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cd180Q62192 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cd180Q62192 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cd180Q62192 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cd180Q62192 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cd180Q62192 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cd180Q62192 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cd180Q62192 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cd180Q62192 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cd180Q62192 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Cd180Q62192 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cd180Q62192 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cd180Q62192 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Cd180Q62192 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Cd180Q62192 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cd180Q62192 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cd180Q62192 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cd180Q62192 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cd180Q62192 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cd180Q62192 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cd180Q62192 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cd180Q62192 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cd180Q62192 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cd180Q62192 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cd180Q62192 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cd180Q62192 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cd180Q62192 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cd180Q62192 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cd180Q62192 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cd180Q62192 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cd180Q62192 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Cd180Q62192 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cd180Q62192 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cd180Q62192 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cd180Q62192 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cd180Q62192 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cd180Q62192 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Cd180Q62192 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cd180Q62192 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cd180Q62192 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cd180Q62192 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cd180Q62192 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cd180Q62192 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cd180Q62192 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cd180Q62192 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cd180Q62192 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cd180Q62192 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cd180Q62192 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cd180Q62192 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cd180Q62192 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cd180Q62192 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cd180Q62192 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cd180Q62192 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cd180Q62192 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cd180Q62192 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cd180Q62192 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cd180Q62192 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cd180Q62192 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cd180Q62192 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cd180Q62192 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cd180Q62192 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cd180Q62192 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cd180Q62192 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cd180Q62192 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cd180Q62192 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cd180Q62192 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cd180Q62192 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cd180Q62192 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cd180Q62192 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cd180Q62192 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cd180Q62192 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cd180Q62192 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cd180Q62192 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cd180Q62192 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cd180Q62192 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cd180Q62192 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cd180Q62192 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cd180Q62192 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cd180Q62192 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cd180Q62192 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cd180Q62192 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cd180Q62192 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cd180Q62192 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cd180Q62192 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cd180Q62192 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cd180Q62192 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cd180Q62192 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cd180Q62192 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cd180Q62192 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cd180Q62192 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cd180Q62192 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cd180Q62192 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms