Protein–RNA interactions for Protein: Q61985

Nfe2l1, Endoplasmic reticulum membrane sensor NFE2L1, mousemouse

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l1Q61985 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nfe2l1Q61985 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nfe2l1Q61985 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nfe2l1Q61985 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nfe2l1Q61985 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nfe2l1Q61985 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nfe2l1Q61985 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nfe2l1Q61985 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nfe2l1Q61985 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nfe2l1Q61985 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nfe2l1Q61985 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nfe2l1Q61985 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nfe2l1Q61985 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nfe2l1Q61985 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nfe2l1Q61985 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nfe2l1Q61985 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nfe2l1Q61985 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nfe2l1Q61985 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nfe2l1Q61985 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nfe2l1Q61985 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nfe2l1Q61985 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nfe2l1Q61985 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nfe2l1Q61985 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nfe2l1Q61985 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nfe2l1Q61985 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nfe2l1Q61985 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nfe2l1Q61985 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nfe2l1Q61985 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nfe2l1Q61985 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nfe2l1Q61985 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nfe2l1Q61985 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nfe2l1Q61985 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nfe2l1Q61985 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nfe2l1Q61985 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nfe2l1Q61985 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nfe2l1Q61985 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nfe2l1Q61985 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nfe2l1Q61985 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nfe2l1Q61985 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Nfe2l1Q61985 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nfe2l1Q61985 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Nfe2l1Q61985 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nfe2l1Q61985 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nfe2l1Q61985 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nfe2l1Q61985 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nfe2l1Q61985 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nfe2l1Q61985 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nfe2l1Q61985 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nfe2l1Q61985 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nfe2l1Q61985 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nfe2l1Q61985 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nfe2l1Q61985 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nfe2l1Q61985 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nfe2l1Q61985 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nfe2l1Q61985 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nfe2l1Q61985 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nfe2l1Q61985 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nfe2l1Q61985 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Nfe2l1Q61985 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nfe2l1Q61985 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nfe2l1Q61985 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nfe2l1Q61985 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nfe2l1Q61985 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nfe2l1Q61985 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nfe2l1Q61985 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nfe2l1Q61985 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nfe2l1Q61985 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nfe2l1Q61985 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nfe2l1Q61985 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nfe2l1Q61985 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nfe2l1Q61985 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nfe2l1Q61985 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nfe2l1Q61985 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nfe2l1Q61985 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nfe2l1Q61985 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nfe2l1Q61985 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nfe2l1Q61985 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nfe2l1Q61985 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nfe2l1Q61985 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nfe2l1Q61985 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nfe2l1Q61985 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nfe2l1Q61985 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nfe2l1Q61985 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nfe2l1Q61985 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nfe2l1Q61985 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nfe2l1Q61985 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nfe2l1Q61985 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nfe2l1Q61985 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nfe2l1Q61985 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nfe2l1Q61985 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nfe2l1Q61985 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nfe2l1Q61985 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nfe2l1Q61985 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nfe2l1Q61985 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nfe2l1Q61985 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nfe2l1Q61985 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nfe2l1Q61985 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nfe2l1Q61985 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nfe2l1Q61985 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Nfe2l1Q61985 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.9 ms