Protein–RNA interactions for Protein: Q61500

Itm2a, Integral membrane protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2aQ61500 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itm2aQ61500 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Itm2aQ61500 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itm2aQ61500 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itm2aQ61500 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itm2aQ61500 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itm2aQ61500 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itm2aQ61500 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itm2aQ61500 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itm2aQ61500 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itm2aQ61500 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itm2aQ61500 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itm2aQ61500 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itm2aQ61500 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itm2aQ61500 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itm2aQ61500 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itm2aQ61500 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itm2aQ61500 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itm2aQ61500 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itm2aQ61500 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itm2aQ61500 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itm2aQ61500 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itm2aQ61500 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itm2aQ61500 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Itm2aQ61500 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itm2aQ61500 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itm2aQ61500 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itm2aQ61500 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itm2aQ61500 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Itm2aQ61500 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Itm2aQ61500 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Itm2aQ61500 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Itm2aQ61500 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Itm2aQ61500 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itm2aQ61500 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itm2aQ61500 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itm2aQ61500 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itm2aQ61500 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itm2aQ61500 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itm2aQ61500 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itm2aQ61500 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itm2aQ61500 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itm2aQ61500 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itm2aQ61500 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itm2aQ61500 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itm2aQ61500 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itm2aQ61500 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itm2aQ61500 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itm2aQ61500 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itm2aQ61500 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itm2aQ61500 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itm2aQ61500 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itm2aQ61500 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itm2aQ61500 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itm2aQ61500 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itm2aQ61500 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itm2aQ61500 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itm2aQ61500 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itm2aQ61500 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itm2aQ61500 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itm2aQ61500 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itm2aQ61500 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itm2aQ61500 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itm2aQ61500 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itm2aQ61500 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Itm2aQ61500 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Itm2aQ61500 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itm2aQ61500 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itm2aQ61500 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itm2aQ61500 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itm2aQ61500 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itm2aQ61500 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Itm2aQ61500 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itm2aQ61500 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itm2aQ61500 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itm2aQ61500 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itm2aQ61500 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itm2aQ61500 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itm2aQ61500 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itm2aQ61500 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itm2aQ61500 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itm2aQ61500 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itm2aQ61500 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itm2aQ61500 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itm2aQ61500 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itm2aQ61500 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itm2aQ61500 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itm2aQ61500 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itm2aQ61500 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itm2aQ61500 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itm2aQ61500 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itm2aQ61500 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itm2aQ61500 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itm2aQ61500 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itm2aQ61500 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itm2aQ61500 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itm2aQ61500 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itm2aQ61500 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itm2aQ61500 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Itm2aQ61500 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms