Protein–RNA interactions for Protein: Q61468

Msln, Mesothelin, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MslnQ61468 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MslnQ61468 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MslnQ61468 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MslnQ61468 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MslnQ61468 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MslnQ61468 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MslnQ61468 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MslnQ61468 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MslnQ61468 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MslnQ61468 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MslnQ61468 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MslnQ61468 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MslnQ61468 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MslnQ61468 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MslnQ61468 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MslnQ61468 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MslnQ61468 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MslnQ61468 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MslnQ61468 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MslnQ61468 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MslnQ61468 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MslnQ61468 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MslnQ61468 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MslnQ61468 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MslnQ61468 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MslnQ61468 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MslnQ61468 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MslnQ61468 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MslnQ61468 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MslnQ61468 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MslnQ61468 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MslnQ61468 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MslnQ61468 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MslnQ61468 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MslnQ61468 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MslnQ61468 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MslnQ61468 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MslnQ61468 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MslnQ61468 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MslnQ61468 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MslnQ61468 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MslnQ61468 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MslnQ61468 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MslnQ61468 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MslnQ61468 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MslnQ61468 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MslnQ61468 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MslnQ61468 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MslnQ61468 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MslnQ61468 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MslnQ61468 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MslnQ61468 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MslnQ61468 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MslnQ61468 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MslnQ61468 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MslnQ61468 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MslnQ61468 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MslnQ61468 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MslnQ61468 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MslnQ61468 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MslnQ61468 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MslnQ61468 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MslnQ61468 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MslnQ61468 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MslnQ61468 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MslnQ61468 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MslnQ61468 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MslnQ61468 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MslnQ61468 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MslnQ61468 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MslnQ61468 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MslnQ61468 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MslnQ61468 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MslnQ61468 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MslnQ61468 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MslnQ61468 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MslnQ61468 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MslnQ61468 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MslnQ61468 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MslnQ61468 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MslnQ61468 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MslnQ61468 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MslnQ61468 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MslnQ61468 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MslnQ61468 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MslnQ61468 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MslnQ61468 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MslnQ61468 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MslnQ61468 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MslnQ61468 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MslnQ61468 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MslnQ61468 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MslnQ61468 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MslnQ61468 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MslnQ61468 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MslnQ61468 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MslnQ61468 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MslnQ61468 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MslnQ61468 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MslnQ61468 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms