Protein–RNA interactions for Protein: Q61249

Igbp1, Immunoglobulin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igbp1Q61249 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Igbp1Q61249 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Igbp1Q61249 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Igbp1Q61249 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Igbp1Q61249 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Igbp1Q61249 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Igbp1Q61249 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Igbp1Q61249 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Igbp1Q61249 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Igbp1Q61249 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Igbp1Q61249 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Igbp1Q61249 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Igbp1Q61249 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Igbp1Q61249 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Igbp1Q61249 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Igbp1Q61249 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Igbp1Q61249 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Igbp1Q61249 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Igbp1Q61249 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Igbp1Q61249 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Igbp1Q61249 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Igbp1Q61249 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Igbp1Q61249 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Igbp1Q61249 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Igbp1Q61249 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Igbp1Q61249 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Igbp1Q61249 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Igbp1Q61249 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Igbp1Q61249 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Igbp1Q61249 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Igbp1Q61249 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Igbp1Q61249 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Igbp1Q61249 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Igbp1Q61249 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Igbp1Q61249 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Igbp1Q61249 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Igbp1Q61249 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Igbp1Q61249 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Igbp1Q61249 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Igbp1Q61249 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Igbp1Q61249 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Igbp1Q61249 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Igbp1Q61249 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Igbp1Q61249 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Igbp1Q61249 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Igbp1Q61249 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Igbp1Q61249 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Igbp1Q61249 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Igbp1Q61249 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Igbp1Q61249 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Igbp1Q61249 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Igbp1Q61249 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Igbp1Q61249 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Igbp1Q61249 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Igbp1Q61249 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Igbp1Q61249 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Igbp1Q61249 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Igbp1Q61249 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Igbp1Q61249 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Igbp1Q61249 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Igbp1Q61249 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Igbp1Q61249 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Igbp1Q61249 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Igbp1Q61249 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Igbp1Q61249 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Igbp1Q61249 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Igbp1Q61249 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Igbp1Q61249 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Igbp1Q61249 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Igbp1Q61249 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Igbp1Q61249 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Igbp1Q61249 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Igbp1Q61249 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Igbp1Q61249 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Igbp1Q61249 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Igbp1Q61249 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Igbp1Q61249 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Igbp1Q61249 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Igbp1Q61249 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Igbp1Q61249 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Igbp1Q61249 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Igbp1Q61249 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Igbp1Q61249 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Igbp1Q61249 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Igbp1Q61249 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Igbp1Q61249 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Igbp1Q61249 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Igbp1Q61249 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Igbp1Q61249 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Igbp1Q61249 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Igbp1Q61249 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Igbp1Q61249 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Igbp1Q61249 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Igbp1Q61249 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Igbp1Q61249 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Igbp1Q61249 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Igbp1Q61249 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Igbp1Q61249 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Igbp1Q61249 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Igbp1Q61249 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms