Protein–RNA interactions for Protein: Q61144

Psen2, Presenilin-2, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen2Q61144 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Psen2Q61144 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Psen2Q61144 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Psen2Q61144 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Psen2Q61144 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Psen2Q61144 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Psen2Q61144 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Psen2Q61144 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Psen2Q61144 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Psen2Q61144 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Psen2Q61144 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Psen2Q61144 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Psen2Q61144 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Psen2Q61144 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Psen2Q61144 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Psen2Q61144 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Psen2Q61144 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Psen2Q61144 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Psen2Q61144 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Psen2Q61144 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Psen2Q61144 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Psen2Q61144 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Psen2Q61144 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Psen2Q61144 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Psen2Q61144 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Psen2Q61144 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Psen2Q61144 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Psen2Q61144 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Psen2Q61144 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Psen2Q61144 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Psen2Q61144 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Psen2Q61144 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Psen2Q61144 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Psen2Q61144 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Psen2Q61144 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Psen2Q61144 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Psen2Q61144 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Psen2Q61144 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Psen2Q61144 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Psen2Q61144 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Psen2Q61144 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Psen2Q61144 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Psen2Q61144 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Psen2Q61144 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Psen2Q61144 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Psen2Q61144 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Psen2Q61144 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Psen2Q61144 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Psen2Q61144 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Psen2Q61144 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Psen2Q61144 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Psen2Q61144 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Psen2Q61144 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Psen2Q61144 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Psen2Q61144 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Psen2Q61144 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Psen2Q61144 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Psen2Q61144 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Psen2Q61144 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Psen2Q61144 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Psen2Q61144 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Psen2Q61144 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Psen2Q61144 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Psen2Q61144 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Psen2Q61144 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Psen2Q61144 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Psen2Q61144 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Psen2Q61144 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Psen2Q61144 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Psen2Q61144 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Psen2Q61144 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Psen2Q61144 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Psen2Q61144 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Psen2Q61144 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Psen2Q61144 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Psen2Q61144 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Psen2Q61144 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Psen2Q61144 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Psen2Q61144 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Psen2Q61144 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Psen2Q61144 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Psen2Q61144 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Psen2Q61144 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Psen2Q61144 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Psen2Q61144 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Psen2Q61144 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Psen2Q61144 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Psen2Q61144 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Psen2Q61144 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Psen2Q61144 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Psen2Q61144 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Psen2Q61144 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Psen2Q61144 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Psen2Q61144 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Psen2Q61144 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Psen2Q61144 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Psen2Q61144 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Psen2Q61144 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Psen2Q61144 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Psen2Q61144 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.7 ms