Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

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Length 930 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trpc6Q61143 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trpc6Q61143 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trpc6Q61143 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Trpc6Q61143 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trpc6Q61143 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Trpc6Q61143 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Trpc6Q61143 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trpc6Q61143 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trpc6Q61143 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trpc6Q61143 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trpc6Q61143 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trpc6Q61143 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trpc6Q61143 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trpc6Q61143 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trpc6Q61143 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trpc6Q61143 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Trpc6Q61143 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trpc6Q61143 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trpc6Q61143 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Trpc6Q61143 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trpc6Q61143 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trpc6Q61143 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trpc6Q61143 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trpc6Q61143 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpc6Q61143 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpc6Q61143 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpc6Q61143 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpc6Q61143 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trpc6Q61143 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trpc6Q61143 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trpc6Q61143 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trpc6Q61143 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpc6Q61143 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpc6Q61143 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trpc6Q61143 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trpc6Q61143 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trpc6Q61143 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trpc6Q61143 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trpc6Q61143 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trpc6Q61143 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trpc6Q61143 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trpc6Q61143 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trpc6Q61143 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trpc6Q61143 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trpc6Q61143 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trpc6Q61143 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trpc6Q61143 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trpc6Q61143 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trpc6Q61143 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Trpc6Q61143 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Trpc6Q61143 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trpc6Q61143 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trpc6Q61143 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trpc6Q61143 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Trpc6Q61143 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trpc6Q61143 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trpc6Q61143 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trpc6Q61143 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trpc6Q61143 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trpc6Q61143 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpc6Q61143 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpc6Q61143 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpc6Q61143 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trpc6Q61143 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Trpc6Q61143 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Trpc6Q61143 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trpc6Q61143 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trpc6Q61143 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trpc6Q61143 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trpc6Q61143 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trpc6Q61143 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpc6Q61143 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpc6Q61143 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpc6Q61143 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpc6Q61143 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpc6Q61143 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpc6Q61143 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpc6Q61143 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpc6Q61143 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpc6Q61143 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trpc6Q61143 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trpc6Q61143 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Trpc6Q61143 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trpc6Q61143 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trpc6Q61143 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpc6Q61143 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpc6Q61143 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpc6Q61143 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpc6Q61143 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trpc6Q61143 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trpc6Q61143 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trpc6Q61143 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpc6Q61143 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpc6Q61143 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpc6Q61143 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpc6Q61143 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpc6Q61143 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpc6Q61143 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpc6Q61143 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
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