Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Klf3Q60980 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Klf3Q60980 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klf3Q60980 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klf3Q60980 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klf3Q60980 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klf3Q60980 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klf3Q60980 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klf3Q60980 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klf3Q60980 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klf3Q60980 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klf3Q60980 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klf3Q60980 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klf3Q60980 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klf3Q60980 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klf3Q60980 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klf3Q60980 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klf3Q60980 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klf3Q60980 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klf3Q60980 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klf3Q60980 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klf3Q60980 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klf3Q60980 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klf3Q60980 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klf3Q60980 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klf3Q60980 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klf3Q60980 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Klf3Q60980 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klf3Q60980 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klf3Q60980 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klf3Q60980 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klf3Q60980 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Klf3Q60980 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klf3Q60980 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klf3Q60980 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Klf3Q60980 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klf3Q60980 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Klf3Q60980 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klf3Q60980 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klf3Q60980 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Klf3Q60980 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klf3Q60980 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klf3Q60980 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klf3Q60980 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klf3Q60980 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klf3Q60980 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Klf3Q60980 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klf3Q60980 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klf3Q60980 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Klf3Q60980 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Klf3Q60980 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Klf3Q60980 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Klf3Q60980 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Klf3Q60980 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klf3Q60980 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klf3Q60980 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klf3Q60980 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klf3Q60980 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klf3Q60980 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Klf3Q60980 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Klf3Q60980 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klf3Q60980 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klf3Q60980 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klf3Q60980 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klf3Q60980 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klf3Q60980 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klf3Q60980 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klf3Q60980 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klf3Q60980 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Klf3Q60980 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klf3Q60980 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klf3Q60980 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klf3Q60980 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klf3Q60980 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klf3Q60980 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Klf3Q60980 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klf3Q60980 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klf3Q60980 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klf3Q60980 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Klf3Q60980 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Klf3Q60980 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Klf3Q60980 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Klf3Q60980 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Klf3Q60980 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Klf3Q60980 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Klf3Q60980 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Klf3Q60980 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Klf3Q60980 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Klf3Q60980 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Klf3Q60980 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Klf3Q60980 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Klf3Q60980 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Klf3Q60980 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Klf3Q60980 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Klf3Q60980 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Klf3Q60980 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Klf3Q60980 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Klf3Q60980 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Klf3Q60980 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Klf3Q60980 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms