Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Neurod1Q60867 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Neurod1Q60867 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Neurod1Q60867 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Neurod1Q60867 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Neurod1Q60867 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Neurod1Q60867 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Neurod1Q60867 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Neurod1Q60867 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Neurod1Q60867 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Neurod1Q60867 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Neurod1Q60867 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Neurod1Q60867 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Neurod1Q60867 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Neurod1Q60867 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Neurod1Q60867 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Neurod1Q60867 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Neurod1Q60867 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Neurod1Q60867 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Neurod1Q60867 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Neurod1Q60867 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Neurod1Q60867 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Neurod1Q60867 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Neurod1Q60867 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Neurod1Q60867 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Neurod1Q60867 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Neurod1Q60867 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Neurod1Q60867 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Neurod1Q60867 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Neurod1Q60867 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Neurod1Q60867 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Neurod1Q60867 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Neurod1Q60867 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Neurod1Q60867 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Neurod1Q60867 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Neurod1Q60867 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Neurod1Q60867 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Neurod1Q60867 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Neurod1Q60867 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Neurod1Q60867 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Neurod1Q60867 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Neurod1Q60867 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Neurod1Q60867 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Neurod1Q60867 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Neurod1Q60867 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Neurod1Q60867 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Neurod1Q60867 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Neurod1Q60867 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Neurod1Q60867 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Neurod1Q60867 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Neurod1Q60867 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Neurod1Q60867 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Neurod1Q60867 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Neurod1Q60867 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Neurod1Q60867 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
Neurod1Q60867 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Neurod1Q60867 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Neurod1Q60867 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Neurod1Q60867 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Neurod1Q60867 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Neurod1Q60867 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Neurod1Q60867 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Neurod1Q60867 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Neurod1Q60867 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Neurod1Q60867 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Neurod1Q60867 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Neurod1Q60867 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Neurod1Q60867 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Neurod1Q60867 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Neurod1Q60867 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Neurod1Q60867 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Neurod1Q60867 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Neurod1Q60867 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Neurod1Q60867 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Neurod1Q60867 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Neurod1Q60867 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Neurod1Q60867 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Neurod1Q60867 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Neurod1Q60867 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Neurod1Q60867 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Neurod1Q60867 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Neurod1Q60867 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Neurod1Q60867 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Neurod1Q60867 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Neurod1Q60867 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Neurod1Q60867 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Neurod1Q60867 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Neurod1Q60867 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Neurod1Q60867 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Neurod1Q60867 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Neurod1Q60867 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Neurod1Q60867 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Neurod1Q60867 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Neurod1Q60867 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Neurod1Q60867 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Neurod1Q60867 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Neurod1Q60867 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Neurod1Q60867 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Neurod1Q60867 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Neurod1Q60867 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.2 ms