Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klf4Q60793 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klf4Q60793 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Klf4Q60793 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klf4Q60793 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klf4Q60793 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klf4Q60793 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Klf4Q60793 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Klf4Q60793 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klf4Q60793 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klf4Q60793 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klf4Q60793 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klf4Q60793 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klf4Q60793 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klf4Q60793 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klf4Q60793 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klf4Q60793 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klf4Q60793 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klf4Q60793 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klf4Q60793 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klf4Q60793 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klf4Q60793 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Klf4Q60793 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Klf4Q60793 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Klf4Q60793 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Klf4Q60793 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Klf4Q60793 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Klf4Q60793 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klf4Q60793 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klf4Q60793 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klf4Q60793 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klf4Q60793 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klf4Q60793 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klf4Q60793 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klf4Q60793 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klf4Q60793 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klf4Q60793 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klf4Q60793 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klf4Q60793 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klf4Q60793 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klf4Q60793 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klf4Q60793 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Klf4Q60793 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klf4Q60793 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klf4Q60793 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klf4Q60793 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klf4Q60793 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klf4Q60793 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klf4Q60793 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klf4Q60793 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klf4Q60793 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klf4Q60793 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klf4Q60793 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klf4Q60793 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klf4Q60793 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klf4Q60793 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klf4Q60793 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klf4Q60793 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klf4Q60793 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klf4Q60793 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klf4Q60793 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klf4Q60793 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klf4Q60793 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klf4Q60793 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klf4Q60793 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klf4Q60793 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klf4Q60793 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klf4Q60793 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klf4Q60793 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klf4Q60793 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klf4Q60793 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klf4Q60793 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klf4Q60793 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klf4Q60793 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klf4Q60793 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klf4Q60793 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klf4Q60793 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klf4Q60793 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klf4Q60793 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klf4Q60793 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klf4Q60793 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klf4Q60793 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klf4Q60793 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klf4Q60793 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klf4Q60793 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klf4Q60793 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Klf4Q60793 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klf4Q60793 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klf4Q60793 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klf4Q60793 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klf4Q60793 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klf4Q60793 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klf4Q60793 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klf4Q60793 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klf4Q60793 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Klf4Q60793 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Klf4Q60793 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klf4Q60793 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Klf4Q60793 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klf4Q60793 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms