Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Csnk2a1Q60737 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Csnk2a1Q60737 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Csnk2a1Q60737 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Csnk2a1Q60737 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csnk2a1Q60737 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csnk2a1Q60737 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csnk2a1Q60737 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csnk2a1Q60737 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csnk2a1Q60737 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csnk2a1Q60737 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csnk2a1Q60737 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csnk2a1Q60737 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Csnk2a1Q60737 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Csnk2a1Q60737 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csnk2a1Q60737 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csnk2a1Q60737 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csnk2a1Q60737 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csnk2a1Q60737 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csnk2a1Q60737 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csnk2a1Q60737 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csnk2a1Q60737 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csnk2a1Q60737 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Csnk2a1Q60737 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csnk2a1Q60737 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csnk2a1Q60737 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csnk2a1Q60737 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csnk2a1Q60737 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csnk2a1Q60737 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Csnk2a1Q60737 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Csnk2a1Q60737 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csnk2a1Q60737 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csnk2a1Q60737 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Csnk2a1Q60737 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csnk2a1Q60737 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csnk2a1Q60737 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Csnk2a1Q60737 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csnk2a1Q60737 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csnk2a1Q60737 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csnk2a1Q60737 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csnk2a1Q60737 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csnk2a1Q60737 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csnk2a1Q60737 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csnk2a1Q60737 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csnk2a1Q60737 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csnk2a1Q60737 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csnk2a1Q60737 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csnk2a1Q60737 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csnk2a1Q60737 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csnk2a1Q60737 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csnk2a1Q60737 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csnk2a1Q60737 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csnk2a1Q60737 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csnk2a1Q60737 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csnk2a1Q60737 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csnk2a1Q60737 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csnk2a1Q60737 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csnk2a1Q60737 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csnk2a1Q60737 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csnk2a1Q60737 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csnk2a1Q60737 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csnk2a1Q60737 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csnk2a1Q60737 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csnk2a1Q60737 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csnk2a1Q60737 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Csnk2a1Q60737 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csnk2a1Q60737 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csnk2a1Q60737 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csnk2a1Q60737 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csnk2a1Q60737 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csnk2a1Q60737 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csnk2a1Q60737 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csnk2a1Q60737 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csnk2a1Q60737 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csnk2a1Q60737 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csnk2a1Q60737 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csnk2a1Q60737 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csnk2a1Q60737 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Csnk2a1Q60737 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csnk2a1Q60737 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csnk2a1Q60737 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csnk2a1Q60737 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csnk2a1Q60737 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csnk2a1Q60737 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csnk2a1Q60737 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csnk2a1Q60737 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csnk2a1Q60737 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csnk2a1Q60737 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csnk2a1Q60737 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csnk2a1Q60737 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csnk2a1Q60737 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csnk2a1Q60737 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Csnk2a1Q60737 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csnk2a1Q60737 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Csnk2a1Q60737 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Csnk2a1Q60737 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csnk2a1Q60737 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Csnk2a1Q60737 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csnk2a1Q60737 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csnk2a1Q60737 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms