Protein–RNA interactions for Protein: Q5XFZ0

UPF0711 protein C18orf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5XFZ0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Q5XFZ0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Q5XFZ0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Q5XFZ0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q5XFZ0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q5XFZ0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q5XFZ0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q5XFZ0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q5XFZ0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q5XFZ0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q5XFZ0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q5XFZ0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q5XFZ0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q5XFZ0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q5XFZ0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q5XFZ0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q5XFZ0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q5XFZ0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q5XFZ0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q5XFZ0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q5XFZ0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q5XFZ0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q5XFZ0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q5XFZ0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q5XFZ0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q5XFZ0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q5XFZ0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q5XFZ0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q5XFZ0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q5XFZ0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q5XFZ0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q5XFZ0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Q5XFZ0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Q5XFZ0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q5XFZ0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q5XFZ0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q5XFZ0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q5XFZ0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q5XFZ0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q5XFZ0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q5XFZ0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q5XFZ0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q5XFZ0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q5XFZ0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q5XFZ0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q5XFZ0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Q5XFZ0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q5XFZ0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q5XFZ0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q5XFZ0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q5XFZ0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q5XFZ0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q5XFZ0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q5XFZ0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q5XFZ0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Q5XFZ0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Q5XFZ0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Q5XFZ0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q5XFZ0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q5XFZ0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Q5XFZ0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q5XFZ0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q5XFZ0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q5XFZ0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q5XFZ0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q5XFZ0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q5XFZ0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q5XFZ0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q5XFZ0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q5XFZ0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q5XFZ0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q5XFZ0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q5XFZ0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q5XFZ0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q5XFZ0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q5XFZ0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q5XFZ0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q5XFZ0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q5XFZ0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q5XFZ0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q5XFZ0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q5XFZ0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Q5XFZ0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q5XFZ0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q5XFZ0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q5XFZ0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q5XFZ0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q5XFZ0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q5XFZ0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q5XFZ0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q5XFZ0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q5XFZ0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q5XFZ0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q5XFZ0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q5XFZ0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q5XFZ0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q5XFZ0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q5XFZ0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q5XFZ0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q5XFZ0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms