Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tdrd5Q5VCS6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tdrd5Q5VCS6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tdrd5Q5VCS6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tdrd5Q5VCS6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tdrd5Q5VCS6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tdrd5Q5VCS6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tdrd5Q5VCS6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tdrd5Q5VCS6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tdrd5Q5VCS6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tdrd5Q5VCS6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tdrd5Q5VCS6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tdrd5Q5VCS6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tdrd5Q5VCS6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tdrd5Q5VCS6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tdrd5Q5VCS6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tdrd5Q5VCS6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tdrd5Q5VCS6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tdrd5Q5VCS6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tdrd5Q5VCS6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tdrd5Q5VCS6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tdrd5Q5VCS6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tdrd5Q5VCS6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tdrd5Q5VCS6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tdrd5Q5VCS6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tdrd5Q5VCS6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tdrd5Q5VCS6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tdrd5Q5VCS6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tdrd5Q5VCS6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tdrd5Q5VCS6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tdrd5Q5VCS6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tdrd5Q5VCS6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tdrd5Q5VCS6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tdrd5Q5VCS6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tdrd5Q5VCS6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tdrd5Q5VCS6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tdrd5Q5VCS6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tdrd5Q5VCS6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tdrd5Q5VCS6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tdrd5Q5VCS6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tdrd5Q5VCS6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tdrd5Q5VCS6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tdrd5Q5VCS6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tdrd5Q5VCS6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tdrd5Q5VCS6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tdrd5Q5VCS6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tdrd5Q5VCS6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tdrd5Q5VCS6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tdrd5Q5VCS6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tdrd5Q5VCS6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tdrd5Q5VCS6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tdrd5Q5VCS6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tdrd5Q5VCS6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tdrd5Q5VCS6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tdrd5Q5VCS6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tdrd5Q5VCS6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tdrd5Q5VCS6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tdrd5Q5VCS6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tdrd5Q5VCS6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tdrd5Q5VCS6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tdrd5Q5VCS6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tdrd5Q5VCS6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tdrd5Q5VCS6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tdrd5Q5VCS6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tdrd5Q5VCS6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tdrd5Q5VCS6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tdrd5Q5VCS6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tdrd5Q5VCS6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tdrd5Q5VCS6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tdrd5Q5VCS6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tdrd5Q5VCS6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tdrd5Q5VCS6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tdrd5Q5VCS6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tdrd5Q5VCS6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tdrd5Q5VCS6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tdrd5Q5VCS6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tdrd5Q5VCS6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tdrd5Q5VCS6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tdrd5Q5VCS6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tdrd5Q5VCS6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tdrd5Q5VCS6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tdrd5Q5VCS6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tdrd5Q5VCS6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tdrd5Q5VCS6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tdrd5Q5VCS6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tdrd5Q5VCS6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tdrd5Q5VCS6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tdrd5Q5VCS6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tdrd5Q5VCS6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tdrd5Q5VCS6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tdrd5Q5VCS6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tdrd5Q5VCS6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tdrd5Q5VCS6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tdrd5Q5VCS6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tdrd5Q5VCS6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tdrd5Q5VCS6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tdrd5Q5VCS6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tdrd5Q5VCS6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tdrd5Q5VCS6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms