Protein–RNA interactions for Protein: Q5UW37

Cxcl17, C-X-C motif chemokine 17, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl17Q5UW37 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cxcl17Q5UW37 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cxcl17Q5UW37 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cxcl17Q5UW37 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cxcl17Q5UW37 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cxcl17Q5UW37 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cxcl17Q5UW37 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cxcl17Q5UW37 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cxcl17Q5UW37 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Cxcl17Q5UW37 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cxcl17Q5UW37 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cxcl17Q5UW37 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cxcl17Q5UW37 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cxcl17Q5UW37 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cxcl17Q5UW37 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cxcl17Q5UW37 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cxcl17Q5UW37 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cxcl17Q5UW37 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cxcl17Q5UW37 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cxcl17Q5UW37 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cxcl17Q5UW37 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cxcl17Q5UW37 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cxcl17Q5UW37 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cxcl17Q5UW37 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cxcl17Q5UW37 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cxcl17Q5UW37 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cxcl17Q5UW37 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cxcl17Q5UW37 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cxcl17Q5UW37 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cxcl17Q5UW37 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cxcl17Q5UW37 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cxcl17Q5UW37 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cxcl17Q5UW37 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cxcl17Q5UW37 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cxcl17Q5UW37 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cxcl17Q5UW37 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cxcl17Q5UW37 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cxcl17Q5UW37 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cxcl17Q5UW37 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cxcl17Q5UW37 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cxcl17Q5UW37 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cxcl17Q5UW37 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cxcl17Q5UW37 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cxcl17Q5UW37 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cxcl17Q5UW37 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cxcl17Q5UW37 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cxcl17Q5UW37 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cxcl17Q5UW37 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cxcl17Q5UW37 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cxcl17Q5UW37 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cxcl17Q5UW37 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cxcl17Q5UW37 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cxcl17Q5UW37 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cxcl17Q5UW37 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cxcl17Q5UW37 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cxcl17Q5UW37 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cxcl17Q5UW37 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cxcl17Q5UW37 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cxcl17Q5UW37 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cxcl17Q5UW37 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cxcl17Q5UW37 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cxcl17Q5UW37 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cxcl17Q5UW37 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cxcl17Q5UW37 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cxcl17Q5UW37 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cxcl17Q5UW37 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cxcl17Q5UW37 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cxcl17Q5UW37 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cxcl17Q5UW37 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cxcl17Q5UW37 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cxcl17Q5UW37 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cxcl17Q5UW37 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cxcl17Q5UW37 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cxcl17Q5UW37 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cxcl17Q5UW37 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cxcl17Q5UW37 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cxcl17Q5UW37 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cxcl17Q5UW37 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cxcl17Q5UW37 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cxcl17Q5UW37 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cxcl17Q5UW37 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cxcl17Q5UW37 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cxcl17Q5UW37 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cxcl17Q5UW37 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cxcl17Q5UW37 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cxcl17Q5UW37 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cxcl17Q5UW37 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cxcl17Q5UW37 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cxcl17Q5UW37 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cxcl17Q5UW37 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cxcl17Q5UW37 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cxcl17Q5UW37 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cxcl17Q5UW37 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cxcl17Q5UW37 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cxcl17Q5UW37 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cxcl17Q5UW37 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cxcl17Q5UW37 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cxcl17Q5UW37 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cxcl17Q5UW37 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cxcl17Q5UW37 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms