Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc1Q5NCF2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc1Q5NCF2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc1Q5NCF2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc1Q5NCF2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc1Q5NCF2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc1Q5NCF2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc1Q5NCF2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc1Q5NCF2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc1Q5NCF2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc1Q5NCF2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc1Q5NCF2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc1Q5NCF2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc1Q5NCF2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc1Q5NCF2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc1Q5NCF2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc1Q5NCF2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc1Q5NCF2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc1Q5NCF2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc1Q5NCF2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc1Q5NCF2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc1Q5NCF2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc1Q5NCF2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc1Q5NCF2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc1Q5NCF2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc1Q5NCF2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc1Q5NCF2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc1Q5NCF2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc1Q5NCF2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc1Q5NCF2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc1Q5NCF2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc1Q5NCF2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc1Q5NCF2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc1Q5NCF2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc1Q5NCF2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc1Q5NCF2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc1Q5NCF2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc1Q5NCF2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc1Q5NCF2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc1Q5NCF2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc1Q5NCF2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc1Q5NCF2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc1Q5NCF2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc1Q5NCF2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc1Q5NCF2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc1Q5NCF2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc1Q5NCF2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc1Q5NCF2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc1Q5NCF2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc1Q5NCF2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc1Q5NCF2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc1Q5NCF2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc1Q5NCF2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc1Q5NCF2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc1Q5NCF2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc1Q5NCF2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc1Q5NCF2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc1Q5NCF2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc1Q5NCF2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc1Q5NCF2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc1Q5NCF2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc1Q5NCF2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc1Q5NCF2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc1Q5NCF2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc1Q5NCF2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc1Q5NCF2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc1Q5NCF2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc1Q5NCF2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc1Q5NCF2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc1Q5NCF2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc1Q5NCF2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc1Q5NCF2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc1Q5NCF2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc1Q5NCF2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc1Q5NCF2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc1Q5NCF2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc1Q5NCF2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc1Q5NCF2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc1Q5NCF2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc1Q5NCF2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc1Q5NCF2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc1Q5NCF2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc1Q5NCF2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc1Q5NCF2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc1Q5NCF2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc1Q5NCF2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc1Q5NCF2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc1Q5NCF2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc1Q5NCF2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc1Q5NCF2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc1Q5NCF2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc1Q5NCF2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc1Q5NCF2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc1Q5NCF2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc1Q5NCF2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc1Q5NCF2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc1Q5NCF2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc1Q5NCF2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc1Q5NCF2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms