Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Trim41Q5NCC3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC40.66■■■■■ 4.1
Trim41Q5NCC3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Trim41Q5NCC3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Trim41Q5NCC3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Trim41Q5NCC3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
Trim41Q5NCC3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
Trim41Q5NCC3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC40.63■■■■■ 4.09
Trim41Q5NCC3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Trim41Q5NCC3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Trim41Q5NCC3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Trim41Q5NCC3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Trim41Q5NCC3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
Trim41Q5NCC3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Trim41Q5NCC3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Trim41Q5NCC3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Trim41Q5NCC3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
Trim41Q5NCC3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.59■■■■■ 4.09
Trim41Q5NCC3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
Trim41Q5NCC3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
Trim41Q5NCC3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
Trim41Q5NCC3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Trim41Q5NCC3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Trim41Q5NCC3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Trim41Q5NCC3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC40.58■■■■■ 4.09
Trim41Q5NCC3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Trim41Q5NCC3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.09
Trim41Q5NCC3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
Trim41Q5NCC3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC40.56■■■■■ 4.08
Trim41Q5NCC3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Trim41Q5NCC3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
Trim41Q5NCC3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Trim41Q5NCC3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Trim41Q5NCC3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
Trim41Q5NCC3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC40.54■■■■■ 4.08
Trim41Q5NCC3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
Trim41Q5NCC3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Trim41Q5NCC3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC40.53■■■■■ 4.08
Trim41Q5NCC3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
Trim41Q5NCC3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Trim41Q5NCC3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Trim41Q5NCC3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
Trim41Q5NCC3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.07
Trim41Q5NCC3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Trim41Q5NCC3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Trim41Q5NCC3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Trim41Q5NCC3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Trim41Q5NCC3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC40.48■■■■■ 4.07
Trim41Q5NCC3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC40.48■■■■■ 4.07
Trim41Q5NCC3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Trim41Q5NCC3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
Trim41Q5NCC3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
Trim41Q5NCC3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Trim41Q5NCC3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Trim41Q5NCC3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC40.45■■■■■ 4.07
Trim41Q5NCC3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC40.44■■■■■ 4.06
Trim41Q5NCC3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Trim41Q5NCC3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Trim41Q5NCC3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Trim41Q5NCC3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Trim41Q5NCC3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Trim41Q5NCC3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
Trim41Q5NCC3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC40.43■■■■■ 4.06
Trim41Q5NCC3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Trim41Q5NCC3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Trim41Q5NCC3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
Trim41Q5NCC3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Trim41Q5NCC3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC40.42■■■■■ 4.06
Trim41Q5NCC3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
Trim41Q5NCC3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
Trim41Q5NCC3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
Trim41Q5NCC3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Trim41Q5NCC3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC40.39■■■■■ 4.06
Trim41Q5NCC3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
Trim41Q5NCC3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Trim41Q5NCC3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Trim41Q5NCC3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Trim41Q5NCC3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC40.36■■■■■ 4.05
Trim41Q5NCC3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
Trim41Q5NCC3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
Trim41Q5NCC3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Trim41Q5NCC3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
Trim41Q5NCC3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
Trim41Q5NCC3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC40.32■■■■■ 4.05
Trim41Q5NCC3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC40.32■■■■■ 4.05
Trim41Q5NCC3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
Trim41Q5NCC3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Trim41Q5NCC3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
Trim41Q5NCC3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Trim41Q5NCC3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Trim41Q5NCC3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC40.29■■■■■ 4.04
Trim41Q5NCC3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
Trim41Q5NCC3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Trim41Q5NCC3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Trim41Q5NCC3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC40.28■■■■■ 4.04
Trim41Q5NCC3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Trim41Q5NCC3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
Trim41Q5NCC3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Trim41Q5NCC3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
Trim41Q5NCC3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms