Protein–RNA interactions for Protein: Q5JCT0

Gcnt3, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcnt3Q5JCT0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gcnt3Q5JCT0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gcnt3Q5JCT0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gcnt3Q5JCT0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gcnt3Q5JCT0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gcnt3Q5JCT0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gcnt3Q5JCT0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gcnt3Q5JCT0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gcnt3Q5JCT0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gcnt3Q5JCT0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gcnt3Q5JCT0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gcnt3Q5JCT0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gcnt3Q5JCT0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gcnt3Q5JCT0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gcnt3Q5JCT0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gcnt3Q5JCT0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Gcnt3Q5JCT0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gcnt3Q5JCT0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gcnt3Q5JCT0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gcnt3Q5JCT0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gcnt3Q5JCT0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gcnt3Q5JCT0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gcnt3Q5JCT0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gcnt3Q5JCT0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gcnt3Q5JCT0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gcnt3Q5JCT0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gcnt3Q5JCT0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gcnt3Q5JCT0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gcnt3Q5JCT0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gcnt3Q5JCT0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gcnt3Q5JCT0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gcnt3Q5JCT0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gcnt3Q5JCT0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gcnt3Q5JCT0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gcnt3Q5JCT0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gcnt3Q5JCT0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gcnt3Q5JCT0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gcnt3Q5JCT0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gcnt3Q5JCT0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gcnt3Q5JCT0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gcnt3Q5JCT0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gcnt3Q5JCT0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gcnt3Q5JCT0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gcnt3Q5JCT0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gcnt3Q5JCT0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gcnt3Q5JCT0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gcnt3Q5JCT0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gcnt3Q5JCT0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gcnt3Q5JCT0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gcnt3Q5JCT0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gcnt3Q5JCT0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gcnt3Q5JCT0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gcnt3Q5JCT0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gcnt3Q5JCT0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gcnt3Q5JCT0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gcnt3Q5JCT0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gcnt3Q5JCT0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gcnt3Q5JCT0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Gcnt3Q5JCT0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gcnt3Q5JCT0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gcnt3Q5JCT0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gcnt3Q5JCT0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gcnt3Q5JCT0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gcnt3Q5JCT0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gcnt3Q5JCT0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gcnt3Q5JCT0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gcnt3Q5JCT0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gcnt3Q5JCT0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gcnt3Q5JCT0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gcnt3Q5JCT0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gcnt3Q5JCT0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gcnt3Q5JCT0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gcnt3Q5JCT0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gcnt3Q5JCT0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gcnt3Q5JCT0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gcnt3Q5JCT0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gcnt3Q5JCT0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gcnt3Q5JCT0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gcnt3Q5JCT0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gcnt3Q5JCT0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Gcnt3Q5JCT0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gcnt3Q5JCT0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gcnt3Q5JCT0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gcnt3Q5JCT0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gcnt3Q5JCT0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gcnt3Q5JCT0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gcnt3Q5JCT0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gcnt3Q5JCT0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gcnt3Q5JCT0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gcnt3Q5JCT0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gcnt3Q5JCT0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gcnt3Q5JCT0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gcnt3Q5JCT0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gcnt3Q5JCT0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gcnt3Q5JCT0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gcnt3Q5JCT0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gcnt3Q5JCT0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gcnt3Q5JCT0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gcnt3Q5JCT0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gcnt3Q5JCT0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.7 ms