Protein–RNA interactions for Protein: Q5IBH7

Spdya, Speedy protein A, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpdyaQ5IBH7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SpdyaQ5IBH7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SpdyaQ5IBH7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SpdyaQ5IBH7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SpdyaQ5IBH7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SpdyaQ5IBH7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SpdyaQ5IBH7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SpdyaQ5IBH7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SpdyaQ5IBH7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SpdyaQ5IBH7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SpdyaQ5IBH7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SpdyaQ5IBH7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SpdyaQ5IBH7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SpdyaQ5IBH7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SpdyaQ5IBH7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SpdyaQ5IBH7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SpdyaQ5IBH7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SpdyaQ5IBH7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SpdyaQ5IBH7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SpdyaQ5IBH7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SpdyaQ5IBH7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SpdyaQ5IBH7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SpdyaQ5IBH7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SpdyaQ5IBH7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SpdyaQ5IBH7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SpdyaQ5IBH7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SpdyaQ5IBH7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SpdyaQ5IBH7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SpdyaQ5IBH7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SpdyaQ5IBH7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SpdyaQ5IBH7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SpdyaQ5IBH7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SpdyaQ5IBH7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SpdyaQ5IBH7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SpdyaQ5IBH7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SpdyaQ5IBH7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SpdyaQ5IBH7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SpdyaQ5IBH7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SpdyaQ5IBH7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SpdyaQ5IBH7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SpdyaQ5IBH7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SpdyaQ5IBH7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SpdyaQ5IBH7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SpdyaQ5IBH7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SpdyaQ5IBH7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SpdyaQ5IBH7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SpdyaQ5IBH7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SpdyaQ5IBH7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SpdyaQ5IBH7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SpdyaQ5IBH7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SpdyaQ5IBH7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SpdyaQ5IBH7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SpdyaQ5IBH7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SpdyaQ5IBH7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SpdyaQ5IBH7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SpdyaQ5IBH7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SpdyaQ5IBH7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SpdyaQ5IBH7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SpdyaQ5IBH7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SpdyaQ5IBH7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SpdyaQ5IBH7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SpdyaQ5IBH7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SpdyaQ5IBH7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SpdyaQ5IBH7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SpdyaQ5IBH7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SpdyaQ5IBH7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SpdyaQ5IBH7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SpdyaQ5IBH7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SpdyaQ5IBH7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SpdyaQ5IBH7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SpdyaQ5IBH7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SpdyaQ5IBH7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SpdyaQ5IBH7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SpdyaQ5IBH7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SpdyaQ5IBH7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SpdyaQ5IBH7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SpdyaQ5IBH7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SpdyaQ5IBH7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SpdyaQ5IBH7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SpdyaQ5IBH7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SpdyaQ5IBH7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SpdyaQ5IBH7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SpdyaQ5IBH7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SpdyaQ5IBH7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SpdyaQ5IBH7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SpdyaQ5IBH7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SpdyaQ5IBH7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SpdyaQ5IBH7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SpdyaQ5IBH7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SpdyaQ5IBH7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SpdyaQ5IBH7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SpdyaQ5IBH7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SpdyaQ5IBH7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SpdyaQ5IBH7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SpdyaQ5IBH7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SpdyaQ5IBH7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SpdyaQ5IBH7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SpdyaQ5IBH7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SpdyaQ5IBH7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SpdyaQ5IBH7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms