Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prkaa1Q5EG47 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prkaa1Q5EG47 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prkaa1Q5EG47 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prkaa1Q5EG47 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prkaa1Q5EG47 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prkaa1Q5EG47 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prkaa1Q5EG47 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prkaa1Q5EG47 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Prkaa1Q5EG47 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prkaa1Q5EG47 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prkaa1Q5EG47 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prkaa1Q5EG47 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prkaa1Q5EG47 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prkaa1Q5EG47 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prkaa1Q5EG47 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prkaa1Q5EG47 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prkaa1Q5EG47 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prkaa1Q5EG47 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prkaa1Q5EG47 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prkaa1Q5EG47 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prkaa1Q5EG47 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prkaa1Q5EG47 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prkaa1Q5EG47 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prkaa1Q5EG47 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prkaa1Q5EG47 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prkaa1Q5EG47 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prkaa1Q5EG47 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prkaa1Q5EG47 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prkaa1Q5EG47 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prkaa1Q5EG47 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prkaa1Q5EG47 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prkaa1Q5EG47 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prkaa1Q5EG47 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prkaa1Q5EG47 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prkaa1Q5EG47 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prkaa1Q5EG47 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prkaa1Q5EG47 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prkaa1Q5EG47 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prkaa1Q5EG47 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prkaa1Q5EG47 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prkaa1Q5EG47 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prkaa1Q5EG47 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prkaa1Q5EG47 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prkaa1Q5EG47 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prkaa1Q5EG47 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prkaa1Q5EG47 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Prkaa1Q5EG47 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prkaa1Q5EG47 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prkaa1Q5EG47 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prkaa1Q5EG47 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prkaa1Q5EG47 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prkaa1Q5EG47 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prkaa1Q5EG47 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prkaa1Q5EG47 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prkaa1Q5EG47 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prkaa1Q5EG47 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prkaa1Q5EG47 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prkaa1Q5EG47 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Prkaa1Q5EG47 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prkaa1Q5EG47 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prkaa1Q5EG47 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prkaa1Q5EG47 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prkaa1Q5EG47 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prkaa1Q5EG47 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prkaa1Q5EG47 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prkaa1Q5EG47 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prkaa1Q5EG47 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prkaa1Q5EG47 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prkaa1Q5EG47 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prkaa1Q5EG47 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prkaa1Q5EG47 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prkaa1Q5EG47 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prkaa1Q5EG47 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prkaa1Q5EG47 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prkaa1Q5EG47 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prkaa1Q5EG47 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prkaa1Q5EG47 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prkaa1Q5EG47 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prkaa1Q5EG47 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prkaa1Q5EG47 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prkaa1Q5EG47 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prkaa1Q5EG47 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prkaa1Q5EG47 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkaa1Q5EG47 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkaa1Q5EG47 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkaa1Q5EG47 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkaa1Q5EG47 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkaa1Q5EG47 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prkaa1Q5EG47 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prkaa1Q5EG47 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prkaa1Q5EG47 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prkaa1Q5EG47 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkaa1Q5EG47 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkaa1Q5EG47 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkaa1Q5EG47 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkaa1Q5EG47 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prkaa1Q5EG47 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prkaa1Q5EG47 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prkaa1Q5EG47 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms