Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBG6

Hspb6, Heat shock protein beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspb6Q5EBG6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Hspb6Q5EBG6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hspb6Q5EBG6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hspb6Q5EBG6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hspb6Q5EBG6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hspb6Q5EBG6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hspb6Q5EBG6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hspb6Q5EBG6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hspb6Q5EBG6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hspb6Q5EBG6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hspb6Q5EBG6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hspb6Q5EBG6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Hspb6Q5EBG6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hspb6Q5EBG6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hspb6Q5EBG6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Hspb6Q5EBG6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hspb6Q5EBG6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hspb6Q5EBG6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hspb6Q5EBG6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hspb6Q5EBG6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hspb6Q5EBG6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hspb6Q5EBG6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hspb6Q5EBG6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Hspb6Q5EBG6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hspb6Q5EBG6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hspb6Q5EBG6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hspb6Q5EBG6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hspb6Q5EBG6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hspb6Q5EBG6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hspb6Q5EBG6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hspb6Q5EBG6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hspb6Q5EBG6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hspb6Q5EBG6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hspb6Q5EBG6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hspb6Q5EBG6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hspb6Q5EBG6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hspb6Q5EBG6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hspb6Q5EBG6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hspb6Q5EBG6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hspb6Q5EBG6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hspb6Q5EBG6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hspb6Q5EBG6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hspb6Q5EBG6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hspb6Q5EBG6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hspb6Q5EBG6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hspb6Q5EBG6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hspb6Q5EBG6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hspb6Q5EBG6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hspb6Q5EBG6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hspb6Q5EBG6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hspb6Q5EBG6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hspb6Q5EBG6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hspb6Q5EBG6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hspb6Q5EBG6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hspb6Q5EBG6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hspb6Q5EBG6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hspb6Q5EBG6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hspb6Q5EBG6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hspb6Q5EBG6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Hspb6Q5EBG6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hspb6Q5EBG6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hspb6Q5EBG6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hspb6Q5EBG6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hspb6Q5EBG6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hspb6Q5EBG6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hspb6Q5EBG6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hspb6Q5EBG6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hspb6Q5EBG6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hspb6Q5EBG6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hspb6Q5EBG6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hspb6Q5EBG6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hspb6Q5EBG6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Hspb6Q5EBG6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hspb6Q5EBG6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Hspb6Q5EBG6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hspb6Q5EBG6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hspb6Q5EBG6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hspb6Q5EBG6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hspb6Q5EBG6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hspb6Q5EBG6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hspb6Q5EBG6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hspb6Q5EBG6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hspb6Q5EBG6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hspb6Q5EBG6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hspb6Q5EBG6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hspb6Q5EBG6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hspb6Q5EBG6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hspb6Q5EBG6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hspb6Q5EBG6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hspb6Q5EBG6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hspb6Q5EBG6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hspb6Q5EBG6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hspb6Q5EBG6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hspb6Q5EBG6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hspb6Q5EBG6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hspb6Q5EBG6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hspb6Q5EBG6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hspb6Q5EBG6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hspb6Q5EBG6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hspb6Q5EBG6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms