Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTU0

Afap1l2, Actin filament-associated protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afap1l2Q5DTU0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Afap1l2Q5DTU0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Afap1l2Q5DTU0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Afap1l2Q5DTU0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Afap1l2Q5DTU0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Afap1l2Q5DTU0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Afap1l2Q5DTU0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Afap1l2Q5DTU0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Afap1l2Q5DTU0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Afap1l2Q5DTU0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Afap1l2Q5DTU0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Afap1l2Q5DTU0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Afap1l2Q5DTU0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Afap1l2Q5DTU0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Afap1l2Q5DTU0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Afap1l2Q5DTU0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Afap1l2Q5DTU0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Afap1l2Q5DTU0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Afap1l2Q5DTU0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Afap1l2Q5DTU0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Afap1l2Q5DTU0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Afap1l2Q5DTU0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Afap1l2Q5DTU0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Afap1l2Q5DTU0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Afap1l2Q5DTU0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Afap1l2Q5DTU0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Afap1l2Q5DTU0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Afap1l2Q5DTU0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Afap1l2Q5DTU0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Afap1l2Q5DTU0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Afap1l2Q5DTU0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Afap1l2Q5DTU0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Afap1l2Q5DTU0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Afap1l2Q5DTU0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Afap1l2Q5DTU0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Afap1l2Q5DTU0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Afap1l2Q5DTU0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Afap1l2Q5DTU0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Afap1l2Q5DTU0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Afap1l2Q5DTU0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Afap1l2Q5DTU0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Afap1l2Q5DTU0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Afap1l2Q5DTU0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Afap1l2Q5DTU0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Afap1l2Q5DTU0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Afap1l2Q5DTU0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Afap1l2Q5DTU0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Afap1l2Q5DTU0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Afap1l2Q5DTU0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Afap1l2Q5DTU0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Afap1l2Q5DTU0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Afap1l2Q5DTU0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Afap1l2Q5DTU0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Afap1l2Q5DTU0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Afap1l2Q5DTU0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Afap1l2Q5DTU0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Afap1l2Q5DTU0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Afap1l2Q5DTU0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Afap1l2Q5DTU0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Afap1l2Q5DTU0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Afap1l2Q5DTU0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Afap1l2Q5DTU0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Afap1l2Q5DTU0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Afap1l2Q5DTU0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Afap1l2Q5DTU0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Afap1l2Q5DTU0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Afap1l2Q5DTU0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Afap1l2Q5DTU0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Afap1l2Q5DTU0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Afap1l2Q5DTU0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Afap1l2Q5DTU0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Afap1l2Q5DTU0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Afap1l2Q5DTU0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Afap1l2Q5DTU0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Afap1l2Q5DTU0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Afap1l2Q5DTU0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Afap1l2Q5DTU0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Afap1l2Q5DTU0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Afap1l2Q5DTU0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Afap1l2Q5DTU0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Afap1l2Q5DTU0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Afap1l2Q5DTU0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Afap1l2Q5DTU0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Afap1l2Q5DTU0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Afap1l2Q5DTU0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Afap1l2Q5DTU0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Afap1l2Q5DTU0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Afap1l2Q5DTU0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Afap1l2Q5DTU0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Afap1l2Q5DTU0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Afap1l2Q5DTU0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Afap1l2Q5DTU0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Afap1l2Q5DTU0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Afap1l2Q5DTU0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Afap1l2Q5DTU0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Afap1l2Q5DTU0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Afap1l2Q5DTU0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Afap1l2Q5DTU0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Afap1l2Q5DTU0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Afap1l2Q5DTU0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms