Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKS4

Eri2, ERI1 exoribonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eri2Q5BKS4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Eri2Q5BKS4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Eri2Q5BKS4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Eri2Q5BKS4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Eri2Q5BKS4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Eri2Q5BKS4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Eri2Q5BKS4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Eri2Q5BKS4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Eri2Q5BKS4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Eri2Q5BKS4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Eri2Q5BKS4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Eri2Q5BKS4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Eri2Q5BKS4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Eri2Q5BKS4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Eri2Q5BKS4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Eri2Q5BKS4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Eri2Q5BKS4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Eri2Q5BKS4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Eri2Q5BKS4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Eri2Q5BKS4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Eri2Q5BKS4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Eri2Q5BKS4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Eri2Q5BKS4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Eri2Q5BKS4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Eri2Q5BKS4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Eri2Q5BKS4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Eri2Q5BKS4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Eri2Q5BKS4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Eri2Q5BKS4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Eri2Q5BKS4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Eri2Q5BKS4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Eri2Q5BKS4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Eri2Q5BKS4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Eri2Q5BKS4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Eri2Q5BKS4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Eri2Q5BKS4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Eri2Q5BKS4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Eri2Q5BKS4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Eri2Q5BKS4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Eri2Q5BKS4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Eri2Q5BKS4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Eri2Q5BKS4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Eri2Q5BKS4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Eri2Q5BKS4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Eri2Q5BKS4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Eri2Q5BKS4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Eri2Q5BKS4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Eri2Q5BKS4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Eri2Q5BKS4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Eri2Q5BKS4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Eri2Q5BKS4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Eri2Q5BKS4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Eri2Q5BKS4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Eri2Q5BKS4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Eri2Q5BKS4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Eri2Q5BKS4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Eri2Q5BKS4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Eri2Q5BKS4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Eri2Q5BKS4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Eri2Q5BKS4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Eri2Q5BKS4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Eri2Q5BKS4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Eri2Q5BKS4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Eri2Q5BKS4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Eri2Q5BKS4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Eri2Q5BKS4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Eri2Q5BKS4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Eri2Q5BKS4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Eri2Q5BKS4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Eri2Q5BKS4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Eri2Q5BKS4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Eri2Q5BKS4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Eri2Q5BKS4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Eri2Q5BKS4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Eri2Q5BKS4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Eri2Q5BKS4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Eri2Q5BKS4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Eri2Q5BKS4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Eri2Q5BKS4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Eri2Q5BKS4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Eri2Q5BKS4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Eri2Q5BKS4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Eri2Q5BKS4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Eri2Q5BKS4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Eri2Q5BKS4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Eri2Q5BKS4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Eri2Q5BKS4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Eri2Q5BKS4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Eri2Q5BKS4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Eri2Q5BKS4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Eri2Q5BKS4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Eri2Q5BKS4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Eri2Q5BKS4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Eri2Q5BKS4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Eri2Q5BKS4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Eri2Q5BKS4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Eri2Q5BKS4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Eri2Q5BKS4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Eri2Q5BKS4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Eri2Q5BKS4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms