Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Eme2Q56A04 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Eme2Q56A04 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Eme2Q56A04 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Eme2Q56A04 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Eme2Q56A04 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Eme2Q56A04 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Eme2Q56A04 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Eme2Q56A04 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Eme2Q56A04 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Eme2Q56A04 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Eme2Q56A04 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Eme2Q56A04 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Eme2Q56A04 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Eme2Q56A04 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Eme2Q56A04 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Eme2Q56A04 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Eme2Q56A04 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Eme2Q56A04 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Eme2Q56A04 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Eme2Q56A04 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Eme2Q56A04 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Eme2Q56A04 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Eme2Q56A04 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Eme2Q56A04 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Eme2Q56A04 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Eme2Q56A04 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Eme2Q56A04 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Eme2Q56A04 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Eme2Q56A04 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Eme2Q56A04 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Eme2Q56A04 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Eme2Q56A04 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Eme2Q56A04 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Eme2Q56A04 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Eme2Q56A04 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Eme2Q56A04 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Eme2Q56A04 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Eme2Q56A04 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Eme2Q56A04 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Eme2Q56A04 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Eme2Q56A04 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Eme2Q56A04 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Eme2Q56A04 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Eme2Q56A04 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Eme2Q56A04 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Eme2Q56A04 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Eme2Q56A04 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Eme2Q56A04 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Eme2Q56A04 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Eme2Q56A04 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Eme2Q56A04 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Eme2Q56A04 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Eme2Q56A04 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Eme2Q56A04 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Eme2Q56A04 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Eme2Q56A04 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Eme2Q56A04 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Eme2Q56A04 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Eme2Q56A04 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Eme2Q56A04 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Eme2Q56A04 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Eme2Q56A04 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Eme2Q56A04 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Eme2Q56A04 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Eme2Q56A04 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Eme2Q56A04 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Eme2Q56A04 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Eme2Q56A04 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Eme2Q56A04 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Eme2Q56A04 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Eme2Q56A04 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Eme2Q56A04 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Eme2Q56A04 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Eme2Q56A04 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Eme2Q56A04 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Eme2Q56A04 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Eme2Q56A04 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Eme2Q56A04 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Eme2Q56A04 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Eme2Q56A04 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Eme2Q56A04 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Eme2Q56A04 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Eme2Q56A04 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Eme2Q56A04 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Eme2Q56A04 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Eme2Q56A04 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Eme2Q56A04 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Eme2Q56A04 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Eme2Q56A04 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Eme2Q56A04 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Eme2Q56A04 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Eme2Q56A04 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Eme2Q56A04 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Eme2Q56A04 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Eme2Q56A04 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Eme2Q56A04 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Eme2Q56A04 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Eme2Q56A04 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Eme2Q56A04 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms