Protein–RNA interactions for Protein: Q504N7

Pyrin and HIN domain-containing protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q504N7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q504N7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q504N7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q504N7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q504N7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q504N7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q504N7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q504N7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q504N7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q504N7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q504N7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q504N7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q504N7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q504N7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q504N7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q504N7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q504N7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q504N7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q504N7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q504N7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q504N7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q504N7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q504N7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q504N7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q504N7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q504N7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q504N7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q504N7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q504N7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q504N7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q504N7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q504N7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q504N7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q504N7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q504N7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q504N7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q504N7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q504N7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q504N7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q504N7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q504N7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q504N7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q504N7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q504N7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q504N7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q504N7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Q504N7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q504N7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q504N7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q504N7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q504N7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q504N7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q504N7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q504N7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q504N7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q504N7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q504N7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q504N7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q504N7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q504N7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q504N7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q504N7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q504N7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q504N7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q504N7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q504N7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q504N7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q504N7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q504N7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q504N7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q504N7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q504N7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Q504N7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q504N7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Q504N7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q504N7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q504N7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q504N7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q504N7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q504N7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Q504N7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q504N7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q504N7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q504N7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q504N7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q504N7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q504N7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q504N7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q504N7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q504N7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q504N7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q504N7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q504N7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Q504N7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q504N7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q504N7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q504N7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q504N7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q504N7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q504N7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms