Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJN1

C1qtnf9, Complement C1q and tumor necrosis factor-related protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf9Q4ZJN1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C1qtnf9Q4ZJN1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C1qtnf9Q4ZJN1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C1qtnf9Q4ZJN1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
C1qtnf9Q4ZJN1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
C1qtnf9Q4ZJN1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C1qtnf9Q4ZJN1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C1qtnf9Q4ZJN1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C1qtnf9Q4ZJN1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1qtnf9Q4ZJN1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1qtnf9Q4ZJN1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1qtnf9Q4ZJN1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1qtnf9Q4ZJN1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1qtnf9Q4ZJN1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1qtnf9Q4ZJN1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1qtnf9Q4ZJN1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1qtnf9Q4ZJN1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
C1qtnf9Q4ZJN1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C1qtnf9Q4ZJN1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1qtnf9Q4ZJN1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1qtnf9Q4ZJN1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C1qtnf9Q4ZJN1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C1qtnf9Q4ZJN1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C1qtnf9Q4ZJN1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C1qtnf9Q4ZJN1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C1qtnf9Q4ZJN1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1qtnf9Q4ZJN1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1qtnf9Q4ZJN1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
C1qtnf9Q4ZJN1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1qtnf9Q4ZJN1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1qtnf9Q4ZJN1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
C1qtnf9Q4ZJN1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1qtnf9Q4ZJN1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1qtnf9Q4ZJN1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1qtnf9Q4ZJN1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1qtnf9Q4ZJN1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1qtnf9Q4ZJN1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1qtnf9Q4ZJN1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1qtnf9Q4ZJN1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1qtnf9Q4ZJN1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1qtnf9Q4ZJN1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C1qtnf9Q4ZJN1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C1qtnf9Q4ZJN1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C1qtnf9Q4ZJN1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C1qtnf9Q4ZJN1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C1qtnf9Q4ZJN1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C1qtnf9Q4ZJN1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C1qtnf9Q4ZJN1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C1qtnf9Q4ZJN1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C1qtnf9Q4ZJN1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
C1qtnf9Q4ZJN1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C1qtnf9Q4ZJN1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C1qtnf9Q4ZJN1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C1qtnf9Q4ZJN1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1qtnf9Q4ZJN1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1qtnf9Q4ZJN1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1qtnf9Q4ZJN1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1qtnf9Q4ZJN1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1qtnf9Q4ZJN1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1qtnf9Q4ZJN1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1qtnf9Q4ZJN1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1qtnf9Q4ZJN1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C1qtnf9Q4ZJN1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C1qtnf9Q4ZJN1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
C1qtnf9Q4ZJN1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C1qtnf9Q4ZJN1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C1qtnf9Q4ZJN1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
C1qtnf9Q4ZJN1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C1qtnf9Q4ZJN1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C1qtnf9Q4ZJN1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C1qtnf9Q4ZJN1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C1qtnf9Q4ZJN1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C1qtnf9Q4ZJN1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
C1qtnf9Q4ZJN1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
C1qtnf9Q4ZJN1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C1qtnf9Q4ZJN1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C1qtnf9Q4ZJN1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C1qtnf9Q4ZJN1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C1qtnf9Q4ZJN1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C1qtnf9Q4ZJN1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C1qtnf9Q4ZJN1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C1qtnf9Q4ZJN1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C1qtnf9Q4ZJN1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C1qtnf9Q4ZJN1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C1qtnf9Q4ZJN1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms