Protein–RNA interactions for Protein: Q49B93

Slc5a12, Sodium-coupled monocarboxylate transporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a12Q49B93 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Slc5a12Q49B93 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slc5a12Q49B93 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc5a12Q49B93 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc5a12Q49B93 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc5a12Q49B93 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc5a12Q49B93 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc5a12Q49B93 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc5a12Q49B93 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc5a12Q49B93 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc5a12Q49B93 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc5a12Q49B93 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc5a12Q49B93 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc5a12Q49B93 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc5a12Q49B93 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc5a12Q49B93 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc5a12Q49B93 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc5a12Q49B93 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc5a12Q49B93 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc5a12Q49B93 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc5a12Q49B93 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc5a12Q49B93 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc5a12Q49B93 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc5a12Q49B93 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc5a12Q49B93 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc5a12Q49B93 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc5a12Q49B93 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc5a12Q49B93 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc5a12Q49B93 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc5a12Q49B93 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc5a12Q49B93 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc5a12Q49B93 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc5a12Q49B93 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc5a12Q49B93 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc5a12Q49B93 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc5a12Q49B93 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc5a12Q49B93 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc5a12Q49B93 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc5a12Q49B93 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc5a12Q49B93 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc5a12Q49B93 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc5a12Q49B93 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc5a12Q49B93 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc5a12Q49B93 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc5a12Q49B93 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc5a12Q49B93 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc5a12Q49B93 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc5a12Q49B93 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc5a12Q49B93 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc5a12Q49B93 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc5a12Q49B93 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc5a12Q49B93 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc5a12Q49B93 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc5a12Q49B93 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc5a12Q49B93 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc5a12Q49B93 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc5a12Q49B93 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc5a12Q49B93 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc5a12Q49B93 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc5a12Q49B93 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc5a12Q49B93 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc5a12Q49B93 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc5a12Q49B93 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc5a12Q49B93 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc5a12Q49B93 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc5a12Q49B93 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc5a12Q49B93 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc5a12Q49B93 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc5a12Q49B93 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc5a12Q49B93 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc5a12Q49B93 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc5a12Q49B93 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc5a12Q49B93 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc5a12Q49B93 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc5a12Q49B93 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc5a12Q49B93 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc5a12Q49B93 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc5a12Q49B93 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc5a12Q49B93 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc5a12Q49B93 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc5a12Q49B93 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc5a12Q49B93 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc5a12Q49B93 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc5a12Q49B93 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc5a12Q49B93 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc5a12Q49B93 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc5a12Q49B93 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc5a12Q49B93 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc5a12Q49B93 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc5a12Q49B93 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc5a12Q49B93 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc5a12Q49B93 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc5a12Q49B93 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc5a12Q49B93 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc5a12Q49B93 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc5a12Q49B93 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc5a12Q49B93 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc5a12Q49B93 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc5a12Q49B93 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc5a12Q49B93 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms