Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lrrc43Q3V0L5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lrrc43Q3V0L5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Lrrc43Q3V0L5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lrrc43Q3V0L5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lrrc43Q3V0L5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lrrc43Q3V0L5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lrrc43Q3V0L5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lrrc43Q3V0L5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lrrc43Q3V0L5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lrrc43Q3V0L5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lrrc43Q3V0L5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lrrc43Q3V0L5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Lrrc43Q3V0L5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Lrrc43Q3V0L5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lrrc43Q3V0L5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lrrc43Q3V0L5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lrrc43Q3V0L5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lrrc43Q3V0L5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lrrc43Q3V0L5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lrrc43Q3V0L5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lrrc43Q3V0L5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lrrc43Q3V0L5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lrrc43Q3V0L5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lrrc43Q3V0L5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lrrc43Q3V0L5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Lrrc43Q3V0L5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lrrc43Q3V0L5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lrrc43Q3V0L5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lrrc43Q3V0L5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Lrrc43Q3V0L5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Lrrc43Q3V0L5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Lrrc43Q3V0L5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Lrrc43Q3V0L5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Lrrc43Q3V0L5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Lrrc43Q3V0L5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Lrrc43Q3V0L5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Lrrc43Q3V0L5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Lrrc43Q3V0L5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Lrrc43Q3V0L5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Lrrc43Q3V0L5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lrrc43Q3V0L5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lrrc43Q3V0L5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lrrc43Q3V0L5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Lrrc43Q3V0L5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Lrrc43Q3V0L5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Lrrc43Q3V0L5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Lrrc43Q3V0L5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Lrrc43Q3V0L5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Lrrc43Q3V0L5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Lrrc43Q3V0L5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Lrrc43Q3V0L5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lrrc43Q3V0L5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lrrc43Q3V0L5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lrrc43Q3V0L5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lrrc43Q3V0L5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
Lrrc43Q3V0L5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Lrrc43Q3V0L5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Lrrc43Q3V0L5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Lrrc43Q3V0L5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Lrrc43Q3V0L5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Lrrc43Q3V0L5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Lrrc43Q3V0L5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lrrc43Q3V0L5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Lrrc43Q3V0L5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lrrc43Q3V0L5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lrrc43Q3V0L5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lrrc43Q3V0L5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lrrc43Q3V0L5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lrrc43Q3V0L5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lrrc43Q3V0L5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lrrc43Q3V0L5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Lrrc43Q3V0L5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lrrc43Q3V0L5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lrrc43Q3V0L5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lrrc43Q3V0L5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lrrc43Q3V0L5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lrrc43Q3V0L5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lrrc43Q3V0L5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Lrrc43Q3V0L5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lrrc43Q3V0L5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lrrc43Q3V0L5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lrrc43Q3V0L5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lrrc43Q3V0L5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lrrc43Q3V0L5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lrrc43Q3V0L5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lrrc43Q3V0L5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lrrc43Q3V0L5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lrrc43Q3V0L5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lrrc43Q3V0L5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lrrc43Q3V0L5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lrrc43Q3V0L5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lrrc43Q3V0L5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lrrc43Q3V0L5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
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