Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930596D02RikQ3V0H9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930596D02RikQ3V0H9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930596D02RikQ3V0H9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930596D02RikQ3V0H9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930596D02RikQ3V0H9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930596D02RikQ3V0H9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms