Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Skap1Q3UUV5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Skap1Q3UUV5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Skap1Q3UUV5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Skap1Q3UUV5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Skap1Q3UUV5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Skap1Q3UUV5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Skap1Q3UUV5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Skap1Q3UUV5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Skap1Q3UUV5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Skap1Q3UUV5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Skap1Q3UUV5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Skap1Q3UUV5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Skap1Q3UUV5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Skap1Q3UUV5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Skap1Q3UUV5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Skap1Q3UUV5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Skap1Q3UUV5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Skap1Q3UUV5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Skap1Q3UUV5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Skap1Q3UUV5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Skap1Q3UUV5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Skap1Q3UUV5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Skap1Q3UUV5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Skap1Q3UUV5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Skap1Q3UUV5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Skap1Q3UUV5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Skap1Q3UUV5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Skap1Q3UUV5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Skap1Q3UUV5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Skap1Q3UUV5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Skap1Q3UUV5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Skap1Q3UUV5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Skap1Q3UUV5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Skap1Q3UUV5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Skap1Q3UUV5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Skap1Q3UUV5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Skap1Q3UUV5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Skap1Q3UUV5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Skap1Q3UUV5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Skap1Q3UUV5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Skap1Q3UUV5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Skap1Q3UUV5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Skap1Q3UUV5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Skap1Q3UUV5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Skap1Q3UUV5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Skap1Q3UUV5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Skap1Q3UUV5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Skap1Q3UUV5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Skap1Q3UUV5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Skap1Q3UUV5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Skap1Q3UUV5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Skap1Q3UUV5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Skap1Q3UUV5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Skap1Q3UUV5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Skap1Q3UUV5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Skap1Q3UUV5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Skap1Q3UUV5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Skap1Q3UUV5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Skap1Q3UUV5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Skap1Q3UUV5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Skap1Q3UUV5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Skap1Q3UUV5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Skap1Q3UUV5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Skap1Q3UUV5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Skap1Q3UUV5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Skap1Q3UUV5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Skap1Q3UUV5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Skap1Q3UUV5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Skap1Q3UUV5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Skap1Q3UUV5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Skap1Q3UUV5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Skap1Q3UUV5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Skap1Q3UUV5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Skap1Q3UUV5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Skap1Q3UUV5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Skap1Q3UUV5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Skap1Q3UUV5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Skap1Q3UUV5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Skap1Q3UUV5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Skap1Q3UUV5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Skap1Q3UUV5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Skap1Q3UUV5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Skap1Q3UUV5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Skap1Q3UUV5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Skap1Q3UUV5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Skap1Q3UUV5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Skap1Q3UUV5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Skap1Q3UUV5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Skap1Q3UUV5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Skap1Q3UUV5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Skap1Q3UUV5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Skap1Q3UUV5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Skap1Q3UUV5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Skap1Q3UUV5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Skap1Q3UUV5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Skap1Q3UUV5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Skap1Q3UUV5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Skap1Q3UUV5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Skap1Q3UUV5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms