Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rtl4Q3URY0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rtl4Q3URY0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rtl4Q3URY0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rtl4Q3URY0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rtl4Q3URY0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rtl4Q3URY0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtl4Q3URY0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtl4Q3URY0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtl4Q3URY0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtl4Q3URY0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtl4Q3URY0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtl4Q3URY0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtl4Q3URY0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtl4Q3URY0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtl4Q3URY0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtl4Q3URY0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtl4Q3URY0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rtl4Q3URY0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rtl4Q3URY0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rtl4Q3URY0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rtl4Q3URY0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtl4Q3URY0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtl4Q3URY0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtl4Q3URY0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtl4Q3URY0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtl4Q3URY0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtl4Q3URY0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtl4Q3URY0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtl4Q3URY0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtl4Q3URY0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtl4Q3URY0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtl4Q3URY0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtl4Q3URY0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtl4Q3URY0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtl4Q3URY0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtl4Q3URY0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtl4Q3URY0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtl4Q3URY0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtl4Q3URY0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtl4Q3URY0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtl4Q3URY0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtl4Q3URY0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl4Q3URY0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl4Q3URY0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl4Q3URY0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl4Q3URY0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl4Q3URY0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl4Q3URY0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl4Q3URY0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtl4Q3URY0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtl4Q3URY0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtl4Q3URY0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtl4Q3URY0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rtl4Q3URY0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtl4Q3URY0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtl4Q3URY0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtl4Q3URY0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtl4Q3URY0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtl4Q3URY0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtl4Q3URY0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtl4Q3URY0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtl4Q3URY0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtl4Q3URY0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtl4Q3URY0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtl4Q3URY0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtl4Q3URY0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtl4Q3URY0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtl4Q3URY0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtl4Q3URY0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtl4Q3URY0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtl4Q3URY0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtl4Q3URY0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtl4Q3URY0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtl4Q3URY0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtl4Q3URY0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtl4Q3URY0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rtl4Q3URY0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rtl4Q3URY0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rtl4Q3URY0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rtl4Q3URY0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rtl4Q3URY0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtl4Q3URY0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtl4Q3URY0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtl4Q3URY0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtl4Q3URY0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtl4Q3URY0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtl4Q3URY0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtl4Q3URY0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtl4Q3URY0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rtl4Q3URY0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rtl4Q3URY0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rtl4Q3URY0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rtl4Q3URY0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rtl4Q3URY0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rtl4Q3URY0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rtl4Q3URY0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rtl4Q3URY0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rtl4Q3URY0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rtl4Q3URY0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms