Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR97

Snx21, Sorting nexin-21, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx21Q3UR97 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx21Q3UR97 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx21Q3UR97 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx21Q3UR97 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx21Q3UR97 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx21Q3UR97 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx21Q3UR97 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx21Q3UR97 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx21Q3UR97 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx21Q3UR97 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx21Q3UR97 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx21Q3UR97 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx21Q3UR97 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx21Q3UR97 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx21Q3UR97 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snx21Q3UR97 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snx21Q3UR97 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx21Q3UR97 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx21Q3UR97 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx21Q3UR97 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx21Q3UR97 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx21Q3UR97 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx21Q3UR97 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx21Q3UR97 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx21Q3UR97 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx21Q3UR97 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx21Q3UR97 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx21Q3UR97 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx21Q3UR97 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx21Q3UR97 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx21Q3UR97 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx21Q3UR97 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx21Q3UR97 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx21Q3UR97 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx21Q3UR97 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx21Q3UR97 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx21Q3UR97 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx21Q3UR97 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx21Q3UR97 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx21Q3UR97 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx21Q3UR97 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Snx21Q3UR97 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx21Q3UR97 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx21Q3UR97 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx21Q3UR97 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx21Q3UR97 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx21Q3UR97 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx21Q3UR97 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx21Q3UR97 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx21Q3UR97 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx21Q3UR97 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx21Q3UR97 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx21Q3UR97 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx21Q3UR97 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx21Q3UR97 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx21Q3UR97 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx21Q3UR97 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx21Q3UR97 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx21Q3UR97 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx21Q3UR97 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx21Q3UR97 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx21Q3UR97 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx21Q3UR97 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx21Q3UR97 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx21Q3UR97 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx21Q3UR97 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx21Q3UR97 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx21Q3UR97 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx21Q3UR97 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx21Q3UR97 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx21Q3UR97 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx21Q3UR97 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx21Q3UR97 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx21Q3UR97 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx21Q3UR97 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx21Q3UR97 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx21Q3UR97 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx21Q3UR97 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx21Q3UR97 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx21Q3UR97 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx21Q3UR97 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx21Q3UR97 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx21Q3UR97 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx21Q3UR97 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx21Q3UR97 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx21Q3UR97 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx21Q3UR97 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx21Q3UR97 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx21Q3UR97 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx21Q3UR97 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx21Q3UR97 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx21Q3UR97 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx21Q3UR97 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx21Q3UR97 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx21Q3UR97 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx21Q3UR97 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx21Q3UR97 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx21Q3UR97 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx21Q3UR97 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx21Q3UR97 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms