Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sec31aQ3UPL0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sec31aQ3UPL0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sec31aQ3UPL0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sec31aQ3UPL0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sec31aQ3UPL0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sec31aQ3UPL0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sec31aQ3UPL0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sec31aQ3UPL0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sec31aQ3UPL0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sec31aQ3UPL0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sec31aQ3UPL0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sec31aQ3UPL0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sec31aQ3UPL0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sec31aQ3UPL0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sec31aQ3UPL0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sec31aQ3UPL0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sec31aQ3UPL0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sec31aQ3UPL0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sec31aQ3UPL0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sec31aQ3UPL0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sec31aQ3UPL0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sec31aQ3UPL0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sec31aQ3UPL0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sec31aQ3UPL0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sec31aQ3UPL0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sec31aQ3UPL0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sec31aQ3UPL0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sec31aQ3UPL0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sec31aQ3UPL0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sec31aQ3UPL0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sec31aQ3UPL0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sec31aQ3UPL0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sec31aQ3UPL0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sec31aQ3UPL0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sec31aQ3UPL0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sec31aQ3UPL0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sec31aQ3UPL0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sec31aQ3UPL0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sec31aQ3UPL0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sec31aQ3UPL0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sec31aQ3UPL0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sec31aQ3UPL0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sec31aQ3UPL0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sec31aQ3UPL0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Sec31aQ3UPL0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sec31aQ3UPL0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sec31aQ3UPL0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Sec31aQ3UPL0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sec31aQ3UPL0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sec31aQ3UPL0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sec31aQ3UPL0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sec31aQ3UPL0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sec31aQ3UPL0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sec31aQ3UPL0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sec31aQ3UPL0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sec31aQ3UPL0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sec31aQ3UPL0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sec31aQ3UPL0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sec31aQ3UPL0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sec31aQ3UPL0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Sec31aQ3UPL0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sec31aQ3UPL0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sec31aQ3UPL0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sec31aQ3UPL0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sec31aQ3UPL0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sec31aQ3UPL0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sec31aQ3UPL0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sec31aQ3UPL0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sec31aQ3UPL0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sec31aQ3UPL0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sec31aQ3UPL0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sec31aQ3UPL0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sec31aQ3UPL0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sec31aQ3UPL0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sec31aQ3UPL0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sec31aQ3UPL0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sec31aQ3UPL0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sec31aQ3UPL0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sec31aQ3UPL0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sec31aQ3UPL0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sec31aQ3UPL0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sec31aQ3UPL0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sec31aQ3UPL0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sec31aQ3UPL0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sec31aQ3UPL0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sec31aQ3UPL0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sec31aQ3UPL0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sec31aQ3UPL0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sec31aQ3UPL0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Sec31aQ3UPL0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sec31aQ3UPL0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sec31aQ3UPL0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sec31aQ3UPL0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sec31aQ3UPL0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sec31aQ3UPL0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sec31aQ3UPL0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sec31aQ3UPL0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sec31aQ3UPL0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sec31aQ3UPL0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
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